More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1077 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  100 
 
 
426 aa  875    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  67.69 
 
 
421 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  66.99 
 
 
406 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  64.78 
 
 
420 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.67 
 
 
422 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  50.46 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  50.46 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  50.23 
 
 
434 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.03 
 
 
420 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.67 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.04 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.52 
 
 
422 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.2 
 
 
422 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  49.76 
 
 
422 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.4 
 
 
422 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  49.76 
 
 
422 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.52 
 
 
422 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  49.76 
 
 
422 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  45.54 
 
 
432 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  45.77 
 
 
448 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  45.54 
 
 
432 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  45.31 
 
 
432 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  45.5 
 
 
423 aa  361  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  46.08 
 
 
431 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  44.84 
 
 
425 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  44.63 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  43.33 
 
 
430 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  46.39 
 
 
421 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  44.1 
 
 
421 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  44.08 
 
 
423 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  44.08 
 
 
423 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  43.84 
 
 
423 aa  349  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  43.84 
 
 
423 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  43.81 
 
 
425 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  43.6 
 
 
421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  44.26 
 
 
421 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  45.54 
 
 
426 aa  332  6e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  42.83 
 
 
442 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.03 
 
 
434 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  44.42 
 
 
443 aa  330  4e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  43.37 
 
 
418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  44.15 
 
 
428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  43.13 
 
 
422 aa  325  7e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.3 
 
 
431 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  43.65 
 
 
432 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  42.99 
 
 
434 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  45.78 
 
 
432 aa  323  5e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  42.51 
 
 
416 aa  323  5e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  42.57 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  43.33 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  43.9 
 
 
448 aa  320  3e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  43.33 
 
 
435 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  42.51 
 
 
416 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  42.79 
 
 
436 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  42.79 
 
 
436 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  42.79 
 
 
436 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  43.02 
 
 
436 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  43.02 
 
 
436 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  43.02 
 
 
436 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  42.57 
 
 
436 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  43.2 
 
 
428 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  43.36 
 
 
435 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  42.37 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  41.27 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  42.24 
 
 
461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  42.69 
 
 
433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  42.24 
 
 
461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  42.24 
 
 
461 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  42.24 
 
 
455 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.24 
 
 
447 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.28 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  39.58 
 
 
426 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  42.82 
 
 
437 aa  312  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  42.82 
 
 
437 aa  312  9e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  43.24 
 
 
436 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  42.38 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  41.84 
 
 
437 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  42.62 
 
 
428 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  39.95 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  51.57 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  42 
 
 
436 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  41.44 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  41.86 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  42.73 
 
 
440 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  41.86 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  42.99 
 
 
436 aa  303  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  41.88 
 
 
425 aa  303  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.09 
 
 
443 aa  302  6.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  42.06 
 
 
435 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  42.37 
 
 
429 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  42.23 
 
 
436 aa  301  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>