20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0854 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  526  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  51.97 
 
 
259 aa  258  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  55.1 
 
 
256 aa  256  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  53.54 
 
 
259 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  46.8 
 
 
253 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  44.83 
 
 
261 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  44.71 
 
 
267 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  44.83 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  43.84 
 
 
261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  44.33 
 
 
261 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  43.84 
 
 
261 aa  171  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  42.86 
 
 
261 aa  168  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  42.08 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  42.36 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  42.86 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  41.38 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  42.08 
 
 
260 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  42.94 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  32.04 
 
 
418 aa  45.4  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>