23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2792 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2792  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  454  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00007  hypothetical protein  46.08 
 
 		 221 aa  204  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002348  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system component  42.15 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0400  hypothetical protein  40.19 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.458276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3333  hypothetical protein  25.71 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0150205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3433  hypothetical protein  25.96 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305533 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03591  hypothetical protein  24.41 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3226  hypothetical protein  23.63 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000725415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4757  hypothetical protein  27.09 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3608  hypothetical protein  32.39 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290926  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3905  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4040  hypothetical protein  24.9 
 
 		 252 aa  49.3  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0767  hypothetical protein  25.51 
 
 		 231 aa  48.5  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000836076  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0724  hypothetical protein  24.49 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000015789  hitchhiker  0.00185842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3049  hypothetical protein  24.45 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00345897  normal  0.661514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0752  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000104845  normal  0.017498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3564  hypothetical protein  21.88 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000019199  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3237  hypothetical protein  24.49 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000795933  hitchhiker  0.0000110881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3579  hypothetical protein  22.96 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000110891  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0780  hypothetical protein  22.96 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000762567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0812  hypothetical protein  22.44 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000586351  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1690  hypothetical protein  21.74 
 
 		 231 aa  42  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0133  hypothetical protein  24.49 
 
 		 250 aa  41.6  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>