102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4195 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4748  inositol 1-phosphate synthase  90.2 
 
 
363 aa  656    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4195  inositol 1-phosphate synthase  100 
 
 
370 aa  752    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6040  myo-inositol-1-phosphate synthase  84.4 
 
 
362 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186898  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0867  myo-inositol-1-phosphate synthase  83.84 
 
 
362 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4678  myo-inositol-1-phosphate synthase  83.24 
 
 
361 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10045  myo-inositol-1-phosphate synthase ino1  83.57 
 
 
367 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.723979 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37840  inositol 1-phosphate synthase  80.56 
 
 
363 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5376  myo-inositol-1-phosphate synthase  81.82 
 
 
359 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.816285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5465  myo-inositol-1-phosphate synthase  81.82 
 
 
359 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0339184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5752  myo-inositol-1-phosphate synthase  81.82 
 
 
359 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780572  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2528  inositol 1-phosphate synthase  80.17 
 
 
363 aa  598  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3359  inositol 1-phosphate synthase  82.73 
 
 
364 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3703  inositol 1-phosphate synthase  80.78 
 
 
364 aa  599  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3099  myo-inositol-1-phosphate synthase  79.21 
 
 
359 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26610  inositol 1-phosphate synthase  79.89 
 
 
359 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4201  inositol 1-phosphate synthase  78.77 
 
 
357 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2905  myo-inositol-1-phosphate synthase  77.78 
 
 
388 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4846  inositol 1-phosphate synthase  77.68 
 
 
363 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7031  inositol 1-phosphate synthase  79.22 
 
 
363 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5384  inositol 1-phosphate synthase  77.09 
 
 
359 aa  568  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4958  inositol 1-phosphate synthase  78.09 
 
 
359 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2138  myo-inositol-1-phosphate synthase  76.4 
 
 
359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9365  putative myo-inositol-1-phosphate synthase  78.09 
 
 
359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3509  Myo-inositol-1-phosphate synthase  76.69 
 
 
360 aa  554  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4529  myo-inositol-1-phosphate synthase  77.68 
 
 
357 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2614  inositol 1-phosphate synthase  77.5 
 
 
361 aa  552  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7318  myo-inositol-1-phosphate synthase  77.12 
 
 
357 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0347  inositol 1-phosphate synthase  77.53 
 
 
359 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.745624  normal  0.0558836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39310  inositol 1-phosphate synthase  75.48 
 
 
362 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3568  inositol 1-phosphate synthase  76.12 
 
 
359 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.988412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23300  myo-inositol-1-phosphate synthase  74.37 
 
 
361 aa  545  1e-154  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5074  inositol 1-phosphate synthase  75 
 
 
359 aa  541  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.491686  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5081  myo-inositol-1-phosphate synthase  73.95 
 
 
359 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4563  myo-inositol-1-phosphate synthase  72.75 
 
 
359 aa  525  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459247  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0037  Myo-inositol-1-phosphate synthase  69.66 
 
 
359 aa  517  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0291539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1276  putative inositol 1-phosphate synthase  71.07 
 
 
380 aa  510  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5921  Myo-inositol-1-phosphate synthase  69.66 
 
 
359 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0394  Myo-inositol-1-phosphate synthase  62.87 
 
 
402 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3883  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.28 
 
 
367 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397744  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3367  myo-inositol-1-phosphate synthase  60.55 
 
 
381 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00885843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0790  Myo-inositol-1-phosphate synthase  64.33 
 
 
390 aa  458  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0238913 
 
 
-
 
NC_002936  DET0979  myo-inositol-1-phosphate synthase family protein  61.41 
 
 
370 aa  456  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00718854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1160  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.12 
 
 
356 aa  455  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1794  Myo-inositol-1-phosphate synthase  61.56 
 
 
361 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0509898  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4642  Myo-inositol-1-phosphate synthase  63.48 
 
 
362 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00394531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_852  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.41 
 
 
370 aa  456  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000625636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0870  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.41 
 
 
370 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0382  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.84 
 
 
356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.196157  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2694  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.12 
 
 
571 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2585  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.8 
 
 
362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1263  Myo-inositol-1-phosphate synthase  59.72 
 
 
363 aa  443  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0100995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0503  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.72 
 
 
363 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0243  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.27 
 
 
365 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.121242  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0189  Myo-inositol-1-phosphate synthase  59.55 
 
 
365 aa  430  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1314  myo-inositol-1-phosphate synthase  60.72 
 
 
360 aa  425  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0258  Myo-inositol-1-phosphate synthase  55.74 
 
 
369 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1040  myo-inositol-1-phosphate synthase  53.8 
 
 
366 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2381  myo-inositol-1-phosphate synthase  53.55 
 
 
367 aa  395  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0974  myo-inositol-1-phosphate synthase  54.74 
 
 
367 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505463  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0276  myo-inositol-1-phosphate synthase  54.85 
 
 
369 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0101  myo-inositol-1-phosphate synthase  51.8 
 
 
366 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0676  Myo-inositol-1-phosphate synthase  53.42 
 
 
365 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.639702  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2981  myo-inositol-1-phosphate synthase  50.14 
 
 
387 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1378  Myo-inositol-1-phosphate synthase  50.41 
 
 
375 aa  362  6e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0649  myo-inositol-1-phosphate synthase  44.93 
 
 
364 aa  322  8e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1868  Myo-inositol-1-phosphate synthase  47.14 
 
 
359 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1693  myo-inositol-1-phosphate synthase  47.13 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3127  Myo-inositol-1-phosphate synthase  41.85 
 
 
406 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1653  myo-inositol-1-phosphate synthase  41.83 
 
 
354 aa  268  2e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.470823  hitchhiker  0.00129381 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0544  myo-inositol-1-phosphate synthase  43.02 
 
 
351 aa  262  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0738  myo-inositol-1-phosphate synthase  42.74 
 
 
351 aa  257  3e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1718  myo-inositol-1-phosphate synthase  41.01 
 
 
351 aa  255  7e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.537693  normal  0.11872 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0753  myo-inositol-1-phosphate synthase  41.78 
 
 
351 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.170909 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1904  L-myo-inositol-1-phosphate synthase  37.01 
 
 
341 aa  209  6e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0868076 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1307  Myo-inositol-1-phosphate synthase  37.35 
 
 
344 aa  199  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.74041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1313  myo-inositol-1-phosphate synthase  28.26 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00015113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1373  myo-inositol-1-phosphate synthase  27.64 
 
 
382 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0205603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1660  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.53 
 
 
387 aa  78.2  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1026  Inositol-3-phosphate synthase  30.1 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1982  inositol-3-phosphate synthase  30.5 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2679  inositol-3-phosphate synthase  28.8 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2801  Inositol-3-phosphate synthase  28.8 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2906  Inositol-3-phosphate synthase  28.8 
 
 
397 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.0937533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2324  Inositol-3-phosphate synthase  30.57 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0365735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3598  inositol-3-phosphate synthase  27.72 
 
 
396 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2291  inositol-3-phosphate synthase  28.26 
 
 
396 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2332  Inositol-3-phosphate synthase  27.36 
 
 
438 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2420  Inositol-3-phosphate synthase  27.36 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0243061  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0777  Myo-inositol-1-phosphate synthase  30.69 
 
 
415 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.285259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1734  inositol-3-phosphate synthase  24.37 
 
 
448 aa  56.2  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1535  inositol-3-phosphate synthase  25.63 
 
 
438 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2277  inositol-3-phosphate synthase  22.96 
 
 
438 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2400  Inositol-3-phosphate synthase  23.53 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.663346  normal  0.130983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4149  inositol-3-phosphate synthase  23.47 
 
 
435 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4280  Inositol-3-phosphate synthase  23.47 
 
 
435 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4302  Inositol-3-phosphate synthase  23.47 
 
 
435 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  23.14 
 
 
594 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11090  myo-inositol-1-phosphate synthase  27.17 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1195  Inositol-3-phosphate synthase  23.23 
 
 
442 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1213  inositol-3-phosphate synthase  22.27 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>