83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2400 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2400  Inositol-3-phosphate synthase  100 
 
 
441 aa  908    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.663346  normal  0.130983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2277  inositol-3-phosphate synthase  64.52 
 
 
438 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2392  inositol-3-phosphate synthase  67.92 
 
 
424 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1734  inositol-3-phosphate synthase  63.82 
 
 
448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1535  inositol-3-phosphate synthase  62.36 
 
 
438 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2420  Inositol-3-phosphate synthase  62.59 
 
 
438 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0243061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2332  Inositol-3-phosphate synthase  62.36 
 
 
438 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1195  Inositol-3-phosphate synthase  61.47 
 
 
442 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4149  inositol-3-phosphate synthase  60.29 
 
 
435 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4302  Inositol-3-phosphate synthase  60.29 
 
 
435 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4280  Inositol-3-phosphate synthase  60.29 
 
 
435 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4291  inositol-3-phosphate synthase  59.12 
 
 
434 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.025414  normal  0.498741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0688  inositol-3-phosphate synthase  50.97 
 
 
443 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1213  inositol-3-phosphate synthase  50.97 
 
 
451 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2801  Inositol-3-phosphate synthase  44.58 
 
 
397 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2291  inositol-3-phosphate synthase  45.34 
 
 
396 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2906  Inositol-3-phosphate synthase  44.09 
 
 
397 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.0937533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3598  inositol-3-phosphate synthase  43.9 
 
 
396 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2679  inositol-3-phosphate synthase  44.09 
 
 
423 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1026  Inositol-3-phosphate synthase  42.35 
 
 
398 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2530  inositol-3-phosphate synthase  40.64 
 
 
402 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29246  Inositol-3-phosphate synthase (Myo-inositol-1-phosphate synthase) (MI-1-P synthase) (IPS)  31.84 
 
 
537 aa  192  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36109  predicted protein  29.87 
 
 
529 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150781  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45120  predicted protein  29.01 
 
 
530 aa  182  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0929469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0777  Myo-inositol-1-phosphate synthase  30.88 
 
 
415 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.285259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1982  inositol-3-phosphate synthase  32.33 
 
 
416 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1797  Inositol-3-phosphate synthase  31.28 
 
 
406 aa  163  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06440  inositol-3-phosphate synthase, putative  28.75 
 
 
558 aa  163  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11090  myo-inositol-1-phosphate synthase  31.08 
 
 
382 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2324  Inositol-3-phosphate synthase  32.53 
 
 
386 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0365735  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07625  Myo-inositol-1-phosphate synthase (EC 5.5.1.4) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B6CK64]  28.24 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1313  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.32 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00015113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1373  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.82 
 
 
382 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0205603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1660  myo-inositol-1-phosphate synthase  29.15 
 
 
387 aa  63.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1693  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.88 
 
 
359 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2981  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.62 
 
 
387 aa  57  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0101  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.23 
 
 
366 aa  54.7  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2381  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.24 
 
 
367 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1314  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.09 
 
 
360 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0276  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.88 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0974  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.13 
 
 
367 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4846  inositol 1-phosphate synthase  24.41 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4201  inositol 1-phosphate synthase  24.49 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1040  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.49 
 
 
366 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0037  Myo-inositol-1-phosphate synthase  23.62 
 
 
359 aa  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0291539  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5384  inositol 1-phosphate synthase  22.96 
 
 
359 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1263  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.34 
 
 
363 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0100995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4642  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.34 
 
 
362 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00394531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39310  inositol 1-phosphate synthase  23.62 
 
 
362 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1378  Myo-inositol-1-phosphate synthase  21.94 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7318  myo-inositol-1-phosphate synthase  23.47 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4678  myo-inositol-1-phosphate synthase  23.47 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3127  Myo-inositol-1-phosphate synthase  23.12 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4195  inositol 1-phosphate synthase  23.53 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4529  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.96 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0503  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.89 
 
 
363 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4958  inositol 1-phosphate synthase  22.96 
 
 
359 aa  47.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2585  myo-inositol-1-phosphate synthase  25 
 
 
362 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23300  myo-inositol-1-phosphate synthase  21.5 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0189  Myo-inositol-1-phosphate synthase  25.37 
 
 
365 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3509  Myo-inositol-1-phosphate synthase  22.11 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0243  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.88 
 
 
365 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.121242  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7031  inositol 1-phosphate synthase  22.96 
 
 
363 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3099  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.07 
 
 
359 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26610  inositol 1-phosphate synthase  23.3 
 
 
359 aa  47  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2528  inositol 1-phosphate synthase  22.96 
 
 
363 aa  47  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0258  Myo-inositol-1-phosphate synthase  25.13 
 
 
369 aa  46.6  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6040  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.96 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186898  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6934  predicted protein  28.91 
 
 
121 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1276  putative inositol 1-phosphate synthase  22.81 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2138  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.96 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5074  inositol 1-phosphate synthase  22.45 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.491686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2694  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.41 
 
 
571 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0867  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.96 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_002936  DET0979  myo-inositol-1-phosphate synthase family protein  24.02 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00718854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0394  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.24 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37840  inositol 1-phosphate synthase  22.96 
 
 
363 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3703  inositol 1-phosphate synthase  23.04 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0870  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.84 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000218  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1868  Myo-inositol-1-phosphate synthase  23.88 
 
 
359 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3359  inositol 1-phosphate synthase  23.62 
 
 
364 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_852  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.84 
 
 
370 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000625636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3568  inositol 1-phosphate synthase  22.96 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.988412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>