85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2530 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2530  inositol-3-phosphate synthase  100 
 
 
402 aa  827    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2679  inositol-3-phosphate synthase  42.39 
 
 
423 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2906  Inositol-3-phosphate synthase  42.39 
 
 
397 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.0937533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2291  inositol-3-phosphate synthase  43.69 
 
 
396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2801  Inositol-3-phosphate synthase  42.14 
 
 
397 aa  311  9e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1026  Inositol-3-phosphate synthase  43.47 
 
 
398 aa  309  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3598  inositol-3-phosphate synthase  42.52 
 
 
396 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1734  inositol-3-phosphate synthase  40.64 
 
 
448 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2400  Inositol-3-phosphate synthase  40.64 
 
 
441 aa  279  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.663346  normal  0.130983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2277  inositol-3-phosphate synthase  38.65 
 
 
438 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4149  inositol-3-phosphate synthase  39.95 
 
 
435 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4302  Inositol-3-phosphate synthase  39.95 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4280  Inositol-3-phosphate synthase  39.95 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2420  Inositol-3-phosphate synthase  38.67 
 
 
438 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0243061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2332  Inositol-3-phosphate synthase  38.42 
 
 
438 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1195  Inositol-3-phosphate synthase  39.24 
 
 
442 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1535  inositol-3-phosphate synthase  38.18 
 
 
438 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4291  inositol-3-phosphate synthase  43.14 
 
 
434 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.025414  normal  0.498741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0688  inositol-3-phosphate synthase  38.32 
 
 
443 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1213  inositol-3-phosphate synthase  38.32 
 
 
451 aa  245  8e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2392  inositol-3-phosphate synthase  37.34 
 
 
424 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0777  Myo-inositol-1-phosphate synthase  36.09 
 
 
415 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.285259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1797  Inositol-3-phosphate synthase  37.13 
 
 
406 aa  231  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1982  inositol-3-phosphate synthase  36.39 
 
 
416 aa  226  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2324  Inositol-3-phosphate synthase  34.85 
 
 
386 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0365735  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11090  myo-inositol-1-phosphate synthase  32.47 
 
 
382 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45120  predicted protein  28.35 
 
 
530 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0929469  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29246  Inositol-3-phosphate synthase (Myo-inositol-1-phosphate synthase) (MI-1-P synthase) (IPS)  28.35 
 
 
537 aa  125  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0943829 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36109  predicted protein  26.87 
 
 
529 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150781  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06440  inositol-3-phosphate synthase, putative  24.65 
 
 
558 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07625  Myo-inositol-1-phosphate synthase (EC 5.5.1.4) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B6CK64]  25.41 
 
 
382 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1313  myo-inositol-1-phosphate synthase  29.29 
 
 
382 aa  86.3  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00015113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1660  myo-inositol-1-phosphate synthase  29.38 
 
 
387 aa  79.7  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1373  myo-inositol-1-phosphate synthase  29.29 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0205603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3509  Myo-inositol-1-phosphate synthase  27.84 
 
 
360 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1693  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.38 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0101  myo-inositol-1-phosphate synthase  23.04 
 
 
366 aa  57.4  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2694  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.39 
 
 
571 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2381  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.12 
 
 
367 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6934  predicted protein  32.26 
 
 
121 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1314  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.37 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26610  inositol 1-phosphate synthase  26.42 
 
 
359 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4201  inositol 1-phosphate synthase  25.52 
 
 
357 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2528  inositol 1-phosphate synthase  27.64 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0243  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.66 
 
 
365 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.121242  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0189  Myo-inositol-1-phosphate synthase  22.66 
 
 
365 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1263  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.35 
 
 
363 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0100995 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0974  myo-inositol-1-phosphate synthase  23.88 
 
 
367 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505463  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0649  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.82 
 
 
364 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1794  Myo-inositol-1-phosphate synthase  23.28 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0509898  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2981  myo-inositol-1-phosphate synthase  23.04 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0503  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.42 
 
 
363 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4642  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.5 
 
 
362 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00394531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1040  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.79 
 
 
366 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23300  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.13 
 
 
361 aa  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37840  inositol 1-phosphate synthase  26.63 
 
 
363 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1276  putative inositol 1-phosphate synthase  23.96 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0037  Myo-inositol-1-phosphate synthase  25 
 
 
359 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0291539  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7031  inositol 1-phosphate synthase  24.87 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0347  inositol 1-phosphate synthase  26.04 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.745624  normal  0.0558836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4529  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.26 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3568  inositol 1-phosphate synthase  25.39 
 
 
359 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.988412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2905  myo-inositol-1-phosphate synthase  27.09 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0258  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.87 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4678  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.9 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0676  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.31 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.639702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39310  inositol 1-phosphate synthase  26.42 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1868  Myo-inositol-1-phosphate synthase  23.62 
 
 
359 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1378  Myo-inositol-1-phosphate synthase  21.61 
 
 
375 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7318  myo-inositol-1-phosphate synthase  24.74 
 
 
357 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5384  inositol 1-phosphate synthase  25.77 
 
 
359 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2585  myo-inositol-1-phosphate synthase  24 
 
 
362 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2138  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.77 
 
 
359 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2614  inositol 1-phosphate synthase  25.93 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0394  Myo-inositol-1-phosphate synthase  25.15 
 
 
402 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5921  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.39 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9365  putative myo-inositol-1-phosphate synthase  23.83 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0382  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.1 
 
 
356 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.196157  normal  0.0343831 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1307  Myo-inositol-1-phosphate synthase  24.1 
 
 
344 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.74041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1160  myo-inositol-1-phosphate synthase  22.1 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5074  inositol 1-phosphate synthase  25.26 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.491686  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3703  inositol 1-phosphate synthase  25.38 
 
 
364 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0276  myo-inositol-1-phosphate synthase  23.2 
 
 
369 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5081  myo-inositol-1-phosphate synthase  25.5 
 
 
359 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4195  inositol 1-phosphate synthase  24.87 
 
 
370 aa  43.1  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>