99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0503 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0503  myo-inositol-1-phosphate synthase  100 
 
 
363 aa  736    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1263  Myo-inositol-1-phosphate synthase  88.98 
 
 
363 aa  665    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0100995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0243  myo-inositol-1-phosphate synthase  86.16 
 
 
365 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.121242  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0189  Myo-inositol-1-phosphate synthase  86.44 
 
 
365 aa  620  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1314  myo-inositol-1-phosphate synthase  81.39 
 
 
360 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4642  Myo-inositol-1-phosphate synthase  72.91 
 
 
362 aa  534  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00394531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2585  myo-inositol-1-phosphate synthase  72.35 
 
 
362 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2694  myo-inositol-1-phosphate synthase  69.92 
 
 
571 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3883  myo-inositol-1-phosphate synthase  67.88 
 
 
367 aa  511  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397744  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1794  Myo-inositol-1-phosphate synthase  65.45 
 
 
361 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0509898  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_002936  DET0979  myo-inositol-1-phosphate synthase family protein  62.46 
 
 
370 aa  484  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00718854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3367  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.08 
 
 
381 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00885843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_852  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.18 
 
 
370 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000625636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1160  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.38 
 
 
356 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3099  myo-inositol-1-phosphate synthase  64.31 
 
 
359 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0870  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.6 
 
 
370 aa  477  1e-133  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000218  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0394  Myo-inositol-1-phosphate synthase  62.92 
 
 
402 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0382  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.38 
 
 
356 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.196157  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3568  inositol 1-phosphate synthase  62.89 
 
 
359 aa  472  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.988412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4846  inositol 1-phosphate synthase  62.96 
 
 
363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5081  myo-inositol-1-phosphate synthase  63.17 
 
 
359 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4563  myo-inositol-1-phosphate synthase  62.25 
 
 
359 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459247  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4958  inositol 1-phosphate synthase  60.91 
 
 
359 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5921  Myo-inositol-1-phosphate synthase  61.36 
 
 
359 aa  454  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0037  Myo-inositol-1-phosphate synthase  62.61 
 
 
359 aa  455  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0291539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9365  putative myo-inositol-1-phosphate synthase  60.34 
 
 
359 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279573  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5074  inositol 1-phosphate synthase  61.47 
 
 
359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.491686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39310  inositol 1-phosphate synthase  62.04 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5384  inositol 1-phosphate synthase  61.47 
 
 
359 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0790  Myo-inositol-1-phosphate synthase  61.02 
 
 
390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0238913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0347  inositol 1-phosphate synthase  60.62 
 
 
359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.745624  normal  0.0558836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2905  myo-inositol-1-phosphate synthase  58.33 
 
 
388 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4529  myo-inositol-1-phosphate synthase  61.76 
 
 
357 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0867  myo-inositol-1-phosphate synthase  58.24 
 
 
362 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3359  inositol 1-phosphate synthase  61.17 
 
 
364 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7318  myo-inositol-1-phosphate synthase  60.62 
 
 
357 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23300  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.22 
 
 
361 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2528  inositol 1-phosphate synthase  60.22 
 
 
363 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37840  inositol 1-phosphate synthase  60.39 
 
 
363 aa  439  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5752  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.83 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0780572  normal  0.639468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6040  myo-inositol-1-phosphate synthase  58.52 
 
 
362 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186898  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5376  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.83 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.816285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5465  myo-inositol-1-phosphate synthase  59.83 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0339184 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2138  myo-inositol-1-phosphate synthase  60.06 
 
 
359 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4195  inositol 1-phosphate synthase  59.72 
 
 
370 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1276  putative inositol 1-phosphate synthase  59.49 
 
 
380 aa  436  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26610  inositol 1-phosphate synthase  58.92 
 
 
359 aa  435  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3703  inositol 1-phosphate synthase  60.61 
 
 
364 aa  435  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3509  Myo-inositol-1-phosphate synthase  60.28 
 
 
360 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4201  inositol 1-phosphate synthase  59.77 
 
 
357 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7031  inositol 1-phosphate synthase  60.17 
 
 
363 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10045  myo-inositol-1-phosphate synthase ino1  59.66 
 
 
367 aa  428  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.723979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4678  myo-inositol-1-phosphate synthase  58.26 
 
 
361 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2614  inositol 1-phosphate synthase  58.38 
 
 
361 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0149613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4748  inositol 1-phosphate synthase  59.21 
 
 
363 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0258  Myo-inositol-1-phosphate synthase  55.46 
 
 
369 aa  409  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0974  myo-inositol-1-phosphate synthase  56.47 
 
 
367 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.505463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1378  Myo-inositol-1-phosphate synthase  55.31 
 
 
375 aa  398  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0276  myo-inositol-1-phosphate synthase  53.78 
 
 
369 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2981  myo-inositol-1-phosphate synthase  53.91 
 
 
387 aa  394  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2381  myo-inositol-1-phosphate synthase  53.01 
 
 
367 aa  394  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0101  myo-inositol-1-phosphate synthase  54.55 
 
 
366 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1040  myo-inositol-1-phosphate synthase  52.49 
 
 
366 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0676  Myo-inositol-1-phosphate synthase  49.72 
 
 
365 aa  379  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.639702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0649  myo-inositol-1-phosphate synthase  45.98 
 
 
364 aa  331  2e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1868  Myo-inositol-1-phosphate synthase  46.89 
 
 
359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1693  myo-inositol-1-phosphate synthase  48.41 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.23989 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1653  myo-inositol-1-phosphate synthase  45.48 
 
 
354 aa  296  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.470823  hitchhiker  0.00129381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3127  Myo-inositol-1-phosphate synthase  41.51 
 
 
406 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1335  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0544  myo-inositol-1-phosphate synthase  45.76 
 
 
351 aa  278  8e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1718  myo-inositol-1-phosphate synthase  44.66 
 
 
351 aa  272  5.000000000000001e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.537693  normal  0.11872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0738  myo-inositol-1-phosphate synthase  44.51 
 
 
351 aa  264  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0753  myo-inositol-1-phosphate synthase  44.35 
 
 
351 aa  263  4e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.861409  normal  0.170909 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1904  L-myo-inositol-1-phosphate synthase  40.81 
 
 
341 aa  229  6e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0868076 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1307  Myo-inositol-1-phosphate synthase  34.96 
 
 
344 aa  206  5e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.74041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1313  myo-inositol-1-phosphate synthase  28.96 
 
 
382 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00015113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1373  myo-inositol-1-phosphate synthase  28.49 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0205603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1660  myo-inositol-1-phosphate synthase  26.92 
 
 
387 aa  89.7  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1026  Inositol-3-phosphate synthase  31.77 
 
 
398 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1982  inositol-3-phosphate synthase  32.16 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2801  Inositol-3-phosphate synthase  27.2 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2679  inositol-3-phosphate synthase  26.78 
 
 
423 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2906  Inositol-3-phosphate synthase  26.78 
 
 
397 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.0937533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3598  inositol-3-phosphate synthase  28.29 
 
 
396 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2291  inositol-3-phosphate synthase  28.78 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162053  normal  0.0325155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1734  inositol-3-phosphate synthase  26.55 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2332  Inositol-3-phosphate synthase  28.26 
 
 
438 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.790728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2420  Inositol-3-phosphate synthase  28.26 
 
 
438 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0243061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2277  inositol-3-phosphate synthase  27.63 
 
 
438 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404261  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1535  inositol-3-phosphate synthase  28.07 
 
 
438 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2324  Inositol-3-phosphate synthase  31.02 
 
 
386 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0365735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1213  inositol-3-phosphate synthase  28.22 
 
 
451 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0688  inositol-3-phosphate synthase  28.22 
 
 
443 aa  57  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11090  myo-inositol-1-phosphate synthase  30.05 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.417407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0777  Myo-inositol-1-phosphate synthase  30.3 
 
 
415 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.285259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1195  Inositol-3-phosphate synthase  25.88 
 
 
442 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2530  inositol-3-phosphate synthase  26.42 
 
 
402 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2400  Inositol-3-phosphate synthase  24.89 
 
 
441 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.663346  normal  0.130983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4291  inositol-3-phosphate synthase  27.4 
 
 
434 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.025414  normal  0.498741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>