More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3541 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3541  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  100 
 
 
304 aa  605  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6819  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  55.96 
 
 
304 aa  331  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5090  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  59.6 
 
 
300 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142964  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4517  phosphate ABC transporter permease  58.59 
 
 
300 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4604  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.59 
 
 
300 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4900  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  58.59 
 
 
300 aa  323  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1663  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  60.56 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.481341  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10948  phosphate-transport system integral membrane ABC transporter pstA1  59.87 
 
 
304 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4380  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  52.25 
 
 
359 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3924  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  51.01 
 
 
317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8333  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  50.18 
 
 
291 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2935  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  53.61 
 
 
297 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2742  phosphate ABC transporter permease  52.11 
 
 
361 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00664487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0591  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.35 
 
 
299 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3424  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50 
 
 
309 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0873  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.58 
 
 
303 aa  251  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.501959  normal  0.143992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37640  phosphate ABC transporter membrane protein  49.65 
 
 
364 aa  248  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0364  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.83 
 
 
370 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2962  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  45.02 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2080  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  49.13 
 
 
357 aa  242  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8262  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  50 
 
 
694 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735974  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0204  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.17 
 
 
369 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  48.43 
 
 
358 aa  237  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31850  phosphate ABC transporter membrane protein  50.19 
 
 
365 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4650  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  50.35 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0354  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.13 
 
 
354 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0932568  normal  0.0141277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0660  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  54.01 
 
 
354 aa  228  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4979  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  47.55 
 
 
359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4263  phosphate ABC transporter permease  50.42 
 
 
354 aa  224  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2966  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  46.78 
 
 
317 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25600  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  43.59 
 
 
388 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0714898  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01630  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  44.15 
 
 
367 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06960  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  41.12 
 
 
383 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2215  phosphate ABC transporter inner membrane subunit PstA  43.67 
 
 
306 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.59321  normal  0.136565 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0223  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  41.86 
 
 
345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1070  phosphate ABC transporter permease  43.18 
 
 
332 aa  195  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0820  phosphate ABC transporter permease  46.94 
 
 
291 aa  189  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7662  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.42 
 
 
412 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0093  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.35 
 
 
298 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2741  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  40.86 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2812  phosphate transporter permease subunit PtsA  44.39 
 
 
288 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1291  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  37.68 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2165  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.95 
 
 
300 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0795993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2268  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  41.89 
 
 
299 aa  160  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1274  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.71 
 
 
294 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0199  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.4 
 
 
277 aa  158  9e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.998664  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00541  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  36.33 
 
 
289 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.175645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1268  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.6 
 
 
298 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.214152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1886  phosphate ABC transporter permease  33.58 
 
 
281 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2183  phosphate transporter permease subunit PtsA  37.73 
 
 
300 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.806008  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2856  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.84 
 
 
298 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0916  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.66 
 
 
396 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.5424  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1284  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  34.75 
 
 
287 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1348  ABC transporter phosphate permease  34.75 
 
 
287 aa  157  3e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.607986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2313  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.81 
 
 
294 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5387  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  39.53 
 
 
303 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4445  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.5 
 
 
297 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1600  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.33 
 
 
288 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1191  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.47 
 
 
297 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403091  normal  0.235503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2831  phosphate ABC transporter permease protein  38.2 
 
 
283 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0389706  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0884  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.07 
 
 
298 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0561416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1179  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.47 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1309  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  36.72 
 
 
287 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0581  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.91 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2204  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4243  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.11 
 
 
296 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.413721  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2254  phosphate transporter permease subunit PtsA  41.07 
 
 
286 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236094  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1273  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2771  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.5 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.47464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0821  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1302  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.512627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4064  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.76 
 
 
296 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.517165  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4916  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.36 
 
 
294 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345514  normal  0.348017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4136  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.76 
 
 
296 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.474339  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4186  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.76 
 
 
296 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4241  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  35.42 
 
 
296 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2685  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.11 
 
 
301 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206864  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3271  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  38.11 
 
 
301 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176924  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4268  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.42 
 
 
296 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3941  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.42 
 
 
296 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4237  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.42 
 
 
296 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1488  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.47 
 
 
293 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5155  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.42 
 
 
296 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.546708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4090  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.42 
 
 
296 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4169  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.56 
 
 
295 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2370  phosphate transporter permease subunit PtsA  40.47 
 
 
293 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4080  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.11 
 
 
296 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4233  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.56 
 
 
295 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1620  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4202  phosphate transporter permease subunit PtsA  35.42 
 
 
296 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2628  phosphate transporter permease subunit PtsA  39.91 
 
 
294 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381415  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1293  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0575  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4195  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.56 
 
 
295 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.412756  normal  0.0222213 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1487  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1517  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0576  phosphate transporter permease subunit PtsA  36.09 
 
 
297 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1138  phosphate transport system permease protein 2  36.98 
 
 
281 aa  150  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.743483  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03610  phosphate transporter subunit  35.42 
 
 
296 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2221  phosphate ABC transporter permease  40.78 
 
 
304 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.155385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>