More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1692 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1692  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00462281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4070  methionine aminopeptidase  85.71 
 
 
285 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2125  methionine aminopeptidase, type I  83.69 
 
 
287 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.18548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2033  methionine aminopeptidase  83.93 
 
 
285 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.081264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2050  methionine aminopeptidase  83.93 
 
 
285 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2272  methionine aminopeptidase  82.86 
 
 
285 aa  487  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.888452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2096  methionine aminopeptidase  83.93 
 
 
285 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0670638  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12877  methionine aminopeptidase  78.29 
 
 
285 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5885  methionine aminopeptidase, type I  77.5 
 
 
285 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2191  methionine aminopeptidase, type I  72.54 
 
 
284 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0281618  hitchhiker  0.00110779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0968  methionine aminopeptidase  70.11 
 
 
283 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.940482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3209  methionine aminopeptidase, type I  69.04 
 
 
285 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.836059  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10020  methionine aminopeptidase, type I  70.57 
 
 
285 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1319  methionine aminopeptidase, type I  68.44 
 
 
285 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123772  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2574  methionine aminopeptidase  69.4 
 
 
282 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.900231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1245  methionine aminopeptidase  68.68 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.476436  normal  0.0508409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15230  methionine aminopeptidase, type I  70.21 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1412  methionine aminopeptidase type I  66.78 
 
 
298 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1589  methionine aminopeptidase, type I  67.86 
 
 
303 aa  403  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  69.03 
 
 
270 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1690  methionine aminopeptidase, type I  67.25 
 
 
285 aa  397  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1362  methionine aminopeptidase, type I  68.79 
 
 
285 aa  394  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1588  methionine aminopeptidase, type I  66.07 
 
 
292 aa  394  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000312682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3317  methionine aminopeptidase, type I  67.5 
 
 
292 aa  390  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1491  methionine aminopeptidase, type I  65.14 
 
 
293 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.717494  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2122  methionine aminopeptidase, type I  69.72 
 
 
290 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12160  methionine aminopeptidase, type I  65 
 
 
286 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00879026  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13460  methionine aminopeptidase, type I  64.91 
 
 
314 aa  364  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.752514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2038  methionine aminopeptidase, type I  67.88 
 
 
275 aa  363  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.138159  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16620  methionine aminopeptidase, type I  59.93 
 
 
295 aa  357  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0147101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1405  methionine aminopeptidase, type I  53 
 
 
329 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2425  methionine aminopeptidase  54.96 
 
 
328 aa  287  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519627  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2452  methionine aminopeptidase, type I  52.65 
 
 
329 aa  286  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2548  methionine aminopeptidase  52.3 
 
 
329 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  46.9 
 
 
274 aa  254  8e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  46.77 
 
 
279 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  48.79 
 
 
261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  51.63 
 
 
259 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  48.79 
 
 
260 aa  252  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  51.22 
 
 
259 aa  251  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04150  conserved hypothetical protein  45.36 
 
 
418 aa  251  8.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  51.88 
 
 
273 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
256 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  52.5 
 
 
256 aa  249  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  46.33 
 
 
275 aa  249  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  46.77 
 
 
284 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  46.77 
 
 
284 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
260 aa  248  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  50 
 
 
260 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  49.6 
 
 
260 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64750  methionine aminopeptidase  45.55 
 
 
370 aa  248  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991291  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  47.35 
 
 
261 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  46.77 
 
 
261 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
258 aa  245  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  50 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  50 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0940  methionine aminopeptidase  49.19 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0128309  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  50 
 
 
258 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  49.38 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2601  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
258 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2982  methionine aminopeptidase, type I  47.97 
 
 
264 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  48.98 
 
 
260 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3361  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3791  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  47.58 
 
 
260 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  48.98 
 
 
260 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  47.76 
 
 
255 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  51.25 
 
 
253 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  48.98 
 
 
260 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  47.3 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  47.3 
 
 
275 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0706  methionine aminopeptidase  47.97 
 
 
264 aa  237  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.426508  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  51.67 
 
 
262 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  46.8 
 
 
266 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  48.78 
 
 
264 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_19644  predicted protein  50.2 
 
 
268 aa  236  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00530685  normal  0.519725 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  47.3 
 
 
299 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3166  methionine aminopeptidase, type I  47.56 
 
 
264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  45.68 
 
 
276 aa  235  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0221  hypothetical protein  45.97 
 
 
253 aa  234  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1684  hypothetical protein  47.18 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  49.39 
 
 
260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0221  hypothetical protein  46.77 
 
 
253 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1683  hypothetical protein  47.18 
 
 
254 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  45.67 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>