27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0798 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  867    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  34.69 
 
 		 409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  31.55 
 
 		 392 aa  242  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  30.39 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  26.38 
 
 		 444 aa  203  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  26.38 
 
 		 443 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  25.92 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  27.38 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  27.47 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  26.51 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  27.94 
 
 		 454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  27.59 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  24.94 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  26.67 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  27.45 
 
 		 551 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  22.17 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  26.73 
 
 		 208 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  23.66 
 
 		 202 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1899  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.126489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1933  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0806496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0273  hypothetical protein  29.91 
 
 		 532 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1098e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  19.67 
 
 		 198 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  35.71 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  30.26 
 
 		 197 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1432  protein of unknown function DUF445  31.25 
 
 		 377 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  19.79 
 
 		 198 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1382  hypothetical protein  26.79 
 
 		 376 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000601426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>