25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0119 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  100 
 
 		 479 aa  954    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  52.7 
 
 		 576 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  50.97 
 
 		 544 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  48.41 
 
 		 545 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  23.81 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  24.75 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  24.75 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  31.5 
 
 		 1250 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.27 
 
 		 1082 aa  58.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  27.11 
 
 		 1151 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  24.49 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1139 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  21.95 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  23.79 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  26.75 
 
 		 1163 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  23.89 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  32.56 
 
 		 486 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  28.06 
 
 		 1143 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  28.06 
 
 		 1143 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  23.25 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  28.06 
 
 		 1143 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  31.76 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  19.88 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0279  putative nuclease (RecB family)  24.27 
 
 		 472 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.762829  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03011  RecB family nuclease  24.18 
 
 		 472 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.415861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>