More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1165 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1165  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 69 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000036585  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0169  50S ribosomal protein L31  72.73 
 
 		 70 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000457438  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0980  50S ribosomal protein L31  76.12 
 
 		 71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000192079  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1150  50S ribosomal protein L31  76.12 
 
 		 71 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000442402  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1806  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 71 aa  100  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000545345  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0801  ribosomal protein L31  52.17 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000158788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  54.41 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2399  ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00761276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  55.07 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  50.72 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  51.47 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  54.55 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  49.28 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  52.94 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  49.28 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  41.18 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  42.65 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  49.28 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  49.25 
 
 		 70 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  51.52 
 
 		 66 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  50 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  47.06 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  41.79 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 71 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  47.76 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1117  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  hitchhiker  0.000000000000256974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  43.94 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  43.08 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  46.97 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3172  50S ribosomal protein L31  45.59 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  46.38 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  46.58 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  42.62 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  41.18 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  41.43 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2469  50S ribosomal protein L31  45.71 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  48.53 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  44.29 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  47.06 
 
 		 75 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1138  50S ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09270  ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0668884 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  45.45 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  43.28 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  44.93 
 
 		 70 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  47.76 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  40.91 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2858  50S ribosomal protein L31  46.27 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  43.48 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_002936  DET1327  50S ribosomal protein L31  41.79 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00511873  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  44.12 
 
 		 70 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  44.78 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>