20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2995 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2995  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0163  FixH family protein  48.34 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1875  FixH family protein  32.32 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.292425  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0634  hypothetical protein  27.23 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0343  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.011657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2351  hypothetical protein  33.6 
 
 		 168 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000235101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0735  FixH  28.39 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0010  FixH  24.52 
 
 		 166 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0015  FixH family protein  25.62 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3325  integral membrane protein linked to a cation pump-like  27.84 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2796  nitrogen fixation protein fixH  29.63 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0012  FixH  30.56 
 
 		 166 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7462  FixH family protein  25.97 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1527  FixH family protein  29.2 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1961  hypothetical protein  26.35 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3664  FixH family protein  27.61 
 
 		 169 aa  48.9  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.604726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6712  FixH family protein  27.96 
 
 		 166 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0464  FixH family protein  28.7 
 
 		 172 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0404711  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30.67 
 
 		 578 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1367  hypothetical protein  27.27 
 
 		 146 aa  42  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>