202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1013 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
193 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.33 
 
 
193 aa  239  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  56.08 
 
 
201 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.32 
 
 
205 aa  235  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.08 
 
 
192 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55 
 
 
216 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.19 
 
 
192 aa  221  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.95 
 
 
191 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  52.91 
 
 
192 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.68 
 
 
192 aa  204  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  47.62 
 
 
204 aa  204  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.15 
 
 
204 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.11 
 
 
507 aa  202  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.87 
 
 
507 aa  191  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  46.32 
 
 
207 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  45.79 
 
 
207 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.52 
 
 
195 aa  180  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.79 
 
 
192 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.97 
 
 
192 aa  177  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.92 
 
 
191 aa  177  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 
192 aa  177  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
192 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.41 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.38 
 
 
197 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 
218 aa  128  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.24 
 
 
197 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.57 
 
 
193 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.22 
 
 
191 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.64 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.57 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.04 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.57 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.11 
 
 
191 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.57 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 
191 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.57 
 
 
191 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.94 
 
 
192 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.97 
 
 
194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.57 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.57 
 
 
191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.26 
 
 
195 aa  94.4  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.27 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
192 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.75 
 
 
197 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
233 aa  92  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.51 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 
194 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.98 
 
 
196 aa  86.3  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.96 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.31 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.65 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.65 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.4 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.4 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.34 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  36.7 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.34 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  34.78 
 
 
193 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.04 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  30.72 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.46 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.32 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.14 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  35.25 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.34 
 
 
197 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.43 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.3 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.75 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.77 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.47 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.4 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  29.09 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.78 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  29.63 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.5 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.12 
 
 
196 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.19 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.49 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.4 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.01 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.8 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.45 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.18 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2777  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.13 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.52 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2033  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.58 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.74 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.11 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.668833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.15 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  25 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2450  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  0.966087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.34 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>