160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1799 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
192 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.67 
 
 
192 aa  240  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  57.67 
 
 
192 aa  237  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.08 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.52 
 
 
191 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  48.63 
 
 
201 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.63 
 
 
192 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.32 
 
 
191 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.79 
 
 
193 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.12 
 
 
192 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.62 
 
 
205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  42.02 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.63 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.71 
 
 
193 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  42.11 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.16 
 
 
189 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.1 
 
 
195 aa  157  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.27 
 
 
197 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
192 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.78 
 
 
216 aa  155  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  39.15 
 
 
207 aa  147  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  38.1 
 
 
207 aa  144  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.83 
 
 
507 aa  137  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.1 
 
 
507 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 
218 aa  121  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.57 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.57 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.05 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.57 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.46 
 
 
233 aa  95.1  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.75 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.05 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.05 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.05 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.05 
 
 
191 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.53 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.77 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.15 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.81 
 
 
189 aa  88.2  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.29 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.84 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.37 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.37 
 
 
200 aa  85.9  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.98 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.9 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.35 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.92 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.66 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.6 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.65 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.75 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.93 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.51 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.88 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.7 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2777  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.24 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.98 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0238  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  27.51 
 
 
193 aa  62  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000322122  hitchhiker  0.00000000773634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.46 
 
 
206 aa  61.2  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.53 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  30.83 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.78 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.65 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.89 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  27.89 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.37 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  34.25 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  25.93 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  25.4 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  27.37 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.52 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.6 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.6 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  28.76 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.07 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000846124  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.44 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.77 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.9 
 
 
218 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.68 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  26.84 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.95 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.64 
 
 
209 aa  54.7  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.2 
 
 
230 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.29 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
193 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  24.21 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.94 
 
 
256 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1476  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.8 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0158  NADPH-dependent FMN reductase  25 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0621741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.94 
 
 
194 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  24.52 
 
 
222 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  25.83 
 
 
193 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>