123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2263 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
233 aa  475  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.67 
 
 
218 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 
205 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
195 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
192 aa  105  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.62 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
192 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.18 
 
 
507 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.32 
 
 
192 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  32.32 
 
 
201 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.85 
 
 
193 aa  95.5  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 
192 aa  92  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.12 
 
 
191 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 
507 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.02 
 
 
192 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
191 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  31 
 
 
192 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
191 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.88 
 
 
191 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30 
 
 
191 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
191 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30 
 
 
191 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.37 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.47 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.37 
 
 
191 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.37 
 
 
191 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.5 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.47 
 
 
191 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
193 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.01 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.16 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.71 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.11 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  27.37 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  27.37 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  26.29 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
196 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.15 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.39 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.02 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.85 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 
189 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  21.74 
 
 
194 aa  59.3  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.04 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.01 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.77 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.6 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.47 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  26.04 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.65 
 
 
200 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.91 
 
 
197 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2064  azoreductase  25.11 
 
 
211 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000203481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.02 
 
 
199 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  23.96 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0979  hypothetical protein  29.59 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.58351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.38 
 
 
197 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  23.96 
 
 
193 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00905  hypothetical protein  29.59 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.96 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00912  hypothetical protein  29.59 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.258125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2695  hypothetical protein  29.59 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.59295  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  23.96 
 
 
193 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.96 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.51 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.96 
 
 
193 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  24.48 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3388  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.89 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  24.48 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.43 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  23.96 
 
 
193 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3102  azoreductase  24.06 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.0000000000000239048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2222  azoreductase  24.06 
 
 
211 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000166234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2441  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.81 
 
 
206 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543578  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2023  azoreductase  24.06 
 
 
211 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000234094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.35 
 
 
198 aa  51.6  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2351  azoreductase  24.06 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000017557  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2085  azoreductase  23.58 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000156385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2239  azoreductase  23.58 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  24.14 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2269  azoreductase  23.58 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000607817  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.05 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2025  azoreductase  23.58 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.08402e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1642  azoreductase  24.41 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000115875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2266  azoreductase  23.58 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42446e-33 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.59 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.81 
 
 
198 aa  49.3  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.78 
 
 
194 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.85 
 
 
199 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.56 
 
 
194 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  26.12 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3697  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.99 
 
 
197 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  0.563531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  25.75 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>