291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0396 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  100 
 
 
192 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  70.31 
 
 
192 aa  295  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.91 
 
 
193 aa  218  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.09 
 
 
193 aa  210  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.56 
 
 
205 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.4 
 
 
192 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  45.5 
 
 
201 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 
192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.86 
 
 
216 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.68 
 
 
191 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.4 
 
 
191 aa  185  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.01 
 
 
195 aa  177  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.8 
 
 
507 aa  175  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.02 
 
 
192 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.23 
 
 
507 aa  167  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  41.36 
 
 
207 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  41.27 
 
 
204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
204 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.49 
 
 
192 aa  164  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.02 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  40.31 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.43 
 
 
192 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 
197 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.37 
 
 
194 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
189 aa  134  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 
218 aa  131  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.5 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  36.41 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.38 
 
 
191 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  35.9 
 
 
191 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  36.41 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.87 
 
 
191 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.87 
 
 
191 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.87 
 
 
191 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.87 
 
 
191 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  34.87 
 
 
191 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.16 
 
 
197 aa  117  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
193 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 
192 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  37.17 
 
 
189 aa  111  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.72 
 
 
194 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.7 
 
 
197 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.65 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.02 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 
194 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.8 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.59 
 
 
192 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31 
 
 
233 aa  85.5  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  30.93 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.9 
 
 
193 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
193 aa  85.1  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.9 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.9 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.9 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.9 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.9 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.93 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.87 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.38 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  29.76 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.32 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.5 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.57 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.42 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.1 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1379  quinone dependent NADH dehydrogenase  29.02 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.144954  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.08 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.28 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.74 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  28.14 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.03 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.98 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  32.35 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.46 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0979  hypothetical protein  27.72 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.58351  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.88 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.74 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.86 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.6 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00905  hypothetical protein  27.72 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2742  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.72 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00912  hypothetical protein  27.72 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.258125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2695  hypothetical protein  27.72 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.59295  normal  0.489101 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.98 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2777  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.76 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3540  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.43 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  29.32 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.92 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  31.58 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5228  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  28.89 
 
 
272 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  29.87 
 
 
259 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  26.9 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>