35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0083 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  363  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  70.06 
 
 		 173 aa  251  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  67.07 
 
 		 172 aa  239  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  65.48 
 
 		 170 aa  235  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  65.48 
 
 		 170 aa  235  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  66.07 
 
 		 169 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  43.87 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  38.82 
 
 		 155 aa  124  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  46.85 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  43.42 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  41.88 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  38.19 
 
 		 155 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  41.67 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  36.47 
 
 		 337 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  38.82 
 
 		 155 aa  94.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  32.72 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  33.54 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  29.45 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  32.1 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  32.73 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  31.85 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  32.48 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  32.52 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  32.76 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  30.18 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  24.53 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  25.16 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  25.79 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  24.53 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0922  hypothetical protein  31.15 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  32.77 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5309  hypothetical protein  29.24 
 
 		 225 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1929  hypothetical protein  28.46 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05271  hypothetical protein  26.85 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172397  normal  0.0522853 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>