33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1722 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  54.8 
 
 
200 aa  194  7e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  50.27 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  45.61 
 
 
189 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  39.76 
 
 
173 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  38.64 
 
 
155 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  32.52 
 
 
177 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  31.36 
 
 
178 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  36.69 
 
 
155 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  32.12 
 
 
178 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  31.33 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05271  hypothetical protein  35.48 
 
 
127 aa  94.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172397  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  35.98 
 
 
170 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  37.5 
 
 
158 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  37.27 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  37.27 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  34.55 
 
 
173 aa  85.1  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  34.94 
 
 
172 aa  82  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  40.99 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  32.73 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  31.82 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  32.91 
 
 
172 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  36.59 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  34.09 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  34.76 
 
 
170 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  34.76 
 
 
170 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  32.94 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  44 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  30.95 
 
 
162 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  26.77 
 
 
186 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  28.83 
 
 
183 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5309  hypothetical protein  37.36 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0922  hypothetical protein  23.83 
 
 
196 aa  45.4  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>