34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2474 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  100 
 
 
186 aa  386  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  37.58 
 
 
162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  34.97 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  34.97 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  33.33 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  30.63 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  34.38 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  34.38 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  32.92 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  33.75 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  33.75 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  32.5 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  34.59 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  31.85 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  31.06 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  37.23 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  29.01 
 
 
155 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  26.82 
 
 
189 aa  62.4  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  31.48 
 
 
155 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0922  hypothetical protein  27.43 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  26.09 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  31.01 
 
 
200 aa  57.8  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  25.51 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  27.38 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  26.54 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  32.05 
 
 
183 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  26.27 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  27.18 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  27.18 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  25.24 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0045  hypothetical protein  27.19 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0045  hypothetical protein  27.19 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2504  hypothetical protein  27.19 
 
 
168 aa  41.2  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  29.89 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>