30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1804 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  344  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05271  hypothetical protein  97.64 
 
 		 127 aa  245  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172397  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  44.44 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  42.6 
 
 		 189 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  39.38 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  39.76 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  42.77 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  40 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  39.29 
 
 		 178 aa  118  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  35.33 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  31.68 
 
 		 170 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  30.43 
 
 		 173 aa  87.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  30.25 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  29.45 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  28.14 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  27.81 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  27.27 
 
 		 208 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  27.27 
 
 		 208 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  29.38 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  26.99 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  26.99 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  30.91 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  26.42 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  26.09 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  23.12 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  31.87 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  28.75 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>