31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4066 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  44.58 
 
 
158 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  37.65 
 
 
155 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  37.06 
 
 
170 aa  94  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5309  hypothetical protein  37.04 
 
 
225 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  34.16 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  35.8 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  32.61 
 
 
183 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  34.55 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  34.55 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  34.55 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  32.48 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  31.98 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  31.71 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  32.98 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  31.71 
 
 
162 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  34.36 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  34.76 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  46.15 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  30.3 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  44.29 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  51.52 
 
 
200 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  29.45 
 
 
155 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  31.87 
 
 
173 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  32.5 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  48.1  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  28.21 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  25.64 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  27.27 
 
 
178 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2644  hypothetical protein  45.45 
 
 
72 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>