19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5745 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  50.56 
 
 
183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5309  hypothetical protein  48.84 
 
 
225 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  32.98 
 
 
198 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  33.12 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  28.66 
 
 
155 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  32.77 
 
 
173 aa  54.7  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  32.5 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  31.58 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  31.48 
 
 
169 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  31.48 
 
 
170 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  31.48 
 
 
170 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  31.71 
 
 
172 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  30.12 
 
 
172 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  26.52 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  31.85 
 
 
173 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  30.19 
 
 
337 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>