20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05271 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_05271  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172397  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  97.64 
 
 
173 aa  245  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  40.8 
 
 
215 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  35.48 
 
 
216 aa  95.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  37.8 
 
 
189 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  41.8 
 
 
177 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  38.89 
 
 
178 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  37.9 
 
 
178 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  38.89 
 
 
178 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  35.48 
 
 
200 aa  82  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  31.3 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  30.08 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  28.7 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  30.1 
 
 
173 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  28.3 
 
 
172 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  26.09 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  29.51 
 
 
337 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  27.18 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  26.85 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  25.93 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>