More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1504 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 67 aa  139  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  67.16 
 
 		 68 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  67.69 
 
 		 73 aa  103  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  68.18 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0287  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 66 aa  102  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  73.44 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 72 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 73 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  68.25 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  67.69 
 
 		 70 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  70.59 
 
 		 75 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  68.25 
 
 		 73 aa  100  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4835  50S ribosomal protein L31  67.69 
 
 		 65 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  69.84 
 
 		 121 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 66 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  66.67 
 
 		 70 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  68.25 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  70.31 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  68.25 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  63.24 
 
 		 69 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2172  50S ribosomal protein L31P  65.67 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.316232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2781  ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 71 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00270559  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  70.31 
 
 		 75 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  63.64 
 
 		 70 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  62.12 
 
 		 77 aa  97.1  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 71 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2874  LSU ribosomal protein L31P  59.09 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000802115  hitchhiker  0.0000000061454 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 71 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 71 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 69 aa  95.9  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 80 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 76 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 75 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 66 aa  94.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0223  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  70.31 
 
 		 72 aa  95.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  68.75 
 
 		 75 aa  95.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  60 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  60 
 
 		 68 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  94.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  64.71 
 
 		 74 aa  94.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4496  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  57.81 
 
 		 74 aa  94.4  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4428  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  67.19 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4426  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4342  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4312  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 75 aa  93.6  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 75 aa  93.6  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  62.5 
 
 		 70 aa  93.6  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 71 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0490  ribosomal protein L31  61.29 
 
 		 94 aa  92.8  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  58.82 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  60.87 
 
 		 71 aa  92.8  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  61.9 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0828  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00960478  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1150  50S ribosomal protein L31  60.32 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1420  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  64.06 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 81 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  60.29 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0151  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.515789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  56.72 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 72 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2693  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000422577  hitchhiker  0.00222297 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0191  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0170  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6576  ribosomal protein L31  67.21 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.770296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2399  50S ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.728854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  59.09 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 78 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4037  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 72 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  56.06 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 70 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2179  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 82 aa  90.1  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00985809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>