More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2302 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  100 
 
 
273 aa  548  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.65 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.79 
 
 
277 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  47.29 
 
 
281 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  47.43 
 
 
276 aa  249  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  44.32 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  44.69 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  43.27 
 
 
303 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  50.21 
 
 
272 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  43.75 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  43.75 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  41.37 
 
 
299 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 
300 aa  236  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 
300 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 
280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 
280 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.49 
 
 
280 aa  234  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.49 
 
 
280 aa  234  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  42.49 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.49 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.22 
 
 
280 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.7 
 
 
280 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  42.86 
 
 
278 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 
280 aa  228  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
277 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.54 
 
 
283 aa  226  4e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
280 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.12 
 
 
276 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.61 
 
 
276 aa  223  2e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.07 
 
 
279 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.28 
 
 
278 aa  222  6e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.12 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.66 
 
 
279 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  42.86 
 
 
273 aa  217  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  40.22 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.85 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  40.22 
 
 
283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  42.8 
 
 
275 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.63 
 
 
286 aa  208  8e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  45.49 
 
 
272 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.18 
 
 
277 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.42 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
285 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  42.55 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  39.53 
 
 
286 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 
269 aa  194  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  40.62 
 
 
325 aa  194  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  41.7 
 
 
277 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.18 
 
 
272 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.77 
 
 
277 aa  193  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
310 aa  192  6e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  38.77 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.51 
 
 
278 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.4 
 
 
294 aa  189  5.999999999999999e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
248 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 
284 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.41 
 
 
406 aa  187  2e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.91 
 
 
398 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.11 
 
 
281 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0668  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.55 
 
 
408 aa  186  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 
281 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  40.87 
 
 
288 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  45.13 
 
 
553 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.85 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.28 
 
 
280 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 
630 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  36.96 
 
 
287 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.76 
 
 
344 aa  181  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1803  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.95 
 
 
269 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  36.36 
 
 
568 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  34.43 
 
 
283 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.88 
 
 
277 aa  178  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  44.93 
 
 
271 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.84 
 
 
280 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.97 
 
 
281 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
269 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
269 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  43.5 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  38.04 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2736  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
402 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  37.85 
 
 
628 aa  173  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  45.15 
 
 
226 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  44.34 
 
 
226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  39.84 
 
 
571 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  36.86 
 
 
574 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.69 
 
 
395 aa  171  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.74 
 
 
277 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  38.84 
 
 
568 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  37.5 
 
 
380 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  35.25 
 
 
280 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>