More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0905 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  70.79 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  73.56 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 		 89 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  74.16 
 
 		 89 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  69.66 
 
 		 89 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 88 aa  130  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 		 89 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  68.54 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  74.39 
 
 		 87 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  66.29 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3071  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.33844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  67.86 
 
 		 87 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0070  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62720  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.460956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4709  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4487  ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4177  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42790  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4574  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0323645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3605  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.228641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0724  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0155068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4709  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.217974  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0782  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00988358  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  63.95 
 
 		 88 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 87 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 87 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  65.17 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  61.63 
 
 		 88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1111  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1606  30S ribosomal protein S15  62.5 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2773  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4508  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.264804 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2705  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0076009  normal  0.146965 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4028  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776688  normal  0.268185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4397  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.854765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3345  ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 89 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.157077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2919  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.653515  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>