More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3457 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.22 
 
 
231 aa  359  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.82 
 
 
235 aa  358  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.11 
 
 
235 aa  357  9e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  75.86 
 
 
233 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  73.89 
 
 
229 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  74.68 
 
 
235 aa  346  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  77.99 
 
 
213 aa  345  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.43 
 
 
233 aa  345  5e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  75.33 
 
 
233 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  74.25 
 
 
235 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.64 
 
 
231 aa  340  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  71.24 
 
 
235 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.13 
 
 
261 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0980  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.43 
 
 
237 aa  338  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  68.1 
 
 
232 aa  337  9e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4348  glutathione S-transferase  74.64 
 
 
213 aa  333  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0354  Glutathione S-transferase domain protein  72.99 
 
 
233 aa  331  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  72.25 
 
 
214 aa  328  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  68.12 
 
 
229 aa  325  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3416  putative glutathione S-transferase-like protein  70.93 
 
 
232 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3373  putative glutathione S-transferase  70.93 
 
 
232 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0887626  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3409  putative glutathione S-transferase  70.93 
 
 
232 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2524  putative glutathione S-transferase  70.93 
 
 
232 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1120  putative glutathione S-transferase  70.93 
 
 
232 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0258  putative glutathione S-transferase  70.93 
 
 
232 aa  322  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  67.54 
 
 
239 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1238  hypothetical protein  70.04 
 
 
232 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00464821  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5178  glutathione S-transferase-like  65.64 
 
 
232 aa  320  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.14205  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3195  Glutathione S-transferase domain  69.37 
 
 
233 aa  318  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16528  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  68.12 
 
 
229 aa  318  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  63.79 
 
 
235 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  67.25 
 
 
229 aa  303  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  65.37 
 
 
209 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  66.83 
 
 
209 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  62.28 
 
 
239 aa  293  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  61.84 
 
 
229 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  61.23 
 
 
230 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  63.46 
 
 
208 aa  285  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  59.91 
 
 
230 aa  284  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.42 
 
 
209 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  58.33 
 
 
230 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.29 
 
 
230 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  59.47 
 
 
230 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  58.15 
 
 
230 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  59.29 
 
 
230 aa  279  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.41 
 
 
230 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  60.35 
 
 
230 aa  279  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  58.41 
 
 
234 aa  279  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  60.53 
 
 
255 aa  278  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  64.04 
 
 
208 aa  278  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.96 
 
 
230 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2476  Glutathione S-transferase domain  57.27 
 
 
239 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  61.84 
 
 
233 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  57.27 
 
 
235 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2246  glutathione S-transferase-like  57.51 
 
 
237 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.14056 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0662  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.52 
 
 
233 aa  275  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2590  glutathione S-transferase, N- domain  64.36 
 
 
215 aa  274  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.153757  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  57.96 
 
 
230 aa  274  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.96 
 
 
230 aa  274  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.96 
 
 
230 aa  274  9e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2578  glutathione S-transferase, N- domain  64.36 
 
 
215 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539822  normal  0.255018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2846  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.61 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.130993  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2699  glutathione S-transferase, N- domain  64.36 
 
 
215 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2490  glutathione S-transferase, N- domain  64.36 
 
 
215 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00139167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2536  glutathione S-transferase, N- domain  63.86 
 
 
215 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0018218  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.59 
 
 
230 aa  271  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.31 
 
 
231 aa  271  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2458  glutathione S-transferase  63.86 
 
 
215 aa  271  6e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00690199  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02227  predicted glutathione S-transferase  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0437248  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1354  Glutathione S-transferase domain protein  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000942555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02187  hypothetical protein  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0695509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2596  glutathione S-transferase  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000860005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2452  glutathione S-transferase  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.39 
 
 
233 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1350  glutathione S-transferase  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0219801  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2678  glutathione S-transferase  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000401347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3442  glutathione S-transferase  63.37 
 
 
215 aa  268  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000326275  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2851  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.87 
 
 
207 aa  268  5e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0434229  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.33 
 
 
236 aa  268  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.08 
 
 
242 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  54.94 
 
 
239 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  55.9 
 
 
234 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  57.08 
 
 
234 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  61.58 
 
 
211 aa  255  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  54.22 
 
 
240 aa  254  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  55.22 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.02 
 
 
235 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.5 
 
 
211 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  61.5 
 
 
211 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0486  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.61 
 
 
211 aa  251  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302672  normal  0.434346 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  54.78 
 
 
236 aa  250  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  54.31 
 
 
234 aa  248  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.49 
 
 
233 aa  243  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.05 
 
 
208 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.86 
 
 
222 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  54.9 
 
 
223 aa  237  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  57.49 
 
 
228 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1526  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.9 
 
 
241 aa  235  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.824932  normal  0.476803 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1664  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.74 
 
 
240 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.44689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>