209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2333 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2333  transcriptional regulator BolA  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0856009  normal  0.375097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2911  transcriptional regulator BolA  70.79 
 
 		 90 aa  123  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0647  BolA-like protein  60.23 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.81334  normal  0.0407934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0715  BolA family protein  57.95 
 
 		 90 aa  98.6  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.157845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  56.63 
 
 		 85 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0502  BolA family protein  56.1 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.922441  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0646  BolA-like protein  58.23 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192561  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  51.81 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  55.7 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0291  BolA-like protein  50 
 
 		 101 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3427  BolA family protein  50.56 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0538  BolA-like protein  52.33 
 
 		 89 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.501492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0400  BolA-like protein  51.16 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375771  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3232  BolA family protein  46.74 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3556  BolA family protein  48.31 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  0.408235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  46.51 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0689  BolA family protein  55.7 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1979  stress induced morphogen, BolA  54.43 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  53.57 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0204  transcriptional regulator BolA  43.14 
 
 		 114 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6742  BolA family protein  50 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0716166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3696  BolA family protein  51.9 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.664653 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  43.96 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2398  BolA-like protein  47.78 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0850633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0495  BolA-like protein  48.78 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  51.9 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3078  BolA family protein  53.16 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0320  BolA family protein  44.86 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6494  BolA family protein  48.81 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0447385  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2277  transcriptional regulator BolA  51.16 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2026  bolA protein  48.28 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129016  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1948  bolA protein  48.28 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2562  BolA family protein  49.4 
 
 		 93 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2030  BolA family protein  44.94 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2905  BolA-like protein  44.58 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.200502  normal  0.32207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3429  BolA family protein  44.55 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.719936  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1674  transcriptional regulator BolA  44.94 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.205869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7570  hypothetical protein  58.46 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1832  BolA family protein  47.56 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.773392  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1552  BolA family protein  51.35 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.15156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3067  transcriptional regulator BolA  45.56 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1609  morphogene BolA protein  51.35 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.980085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0912  BolA family protein  45.98 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2584  transcriptional regulator BolA  48.05 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4050  stress induced morphogen  48.19 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2263  BolA family protein  50 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0905518  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1040  yciL protein  42.68 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  46.99 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02420  conserved hypothetical protein  39.56 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  49.37 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3299  BolA family protein  46.34 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845093  normal  0.407173 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1839  BolA family protein  47.13 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  43.37 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  45.35 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  50 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  40.24 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  51.19 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  40.91 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  40.7 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  54.76 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  54.76 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  54.76 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1829  BolA family protein  48.81 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367747  normal  0.761747 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39406  predicted protein  35.51 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0761319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  40.91 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1899  BolA family protein  47.62 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0874  BolA family protein  42.86 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.867448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2137  BolA-like protein  46.43 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0460466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  39.53 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  39.77 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  38.37 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  39.02 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1500  BolA family protein  51.81 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.029191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  39.02 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0118  BolA family protein  40.22 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213801  normal  0.0407389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2950  transcriptional regulator BolA  43.53 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1803  BolA family protein  48.1 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0082  BolA family protein  40.96 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  39.02 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  38.37 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  36.05 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1443  BolA-like protein  45.24 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1934  BolA-like protein  45.24 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2300  BolA/YrbA family protein  45.24 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2339  BolA/YrbA family protein  45.24 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1459  BolA family protein  53.01 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102001  hitchhiker  0.00000045086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  40.24 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3371  BolA-like protein  45.24 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1207  BolA-like protein  45.24 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  39.47 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1875  BolA family protein  36.56 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  38.37 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1880  transcriptional regulator BolA  46.99 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  39.02 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  42.68 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  44.44 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1745  hypothetical protein  52.27 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  39.77 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  44.94 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  40.96 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>