192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0077 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  100 
 
 		 196 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0953  nitroreductase  60.21 
 
 		 193 aa  238  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  45.81 
 
 		 191 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  45.65 
 
 		 194 aa  165  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  46.96 
 
 		 187 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  44.44 
 
 		 208 aa  164  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  44.86 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  41.62 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  41.99 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  41.08 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  42.7 
 
 		 187 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  41.92 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  41.36 
 
 		 208 aa  151  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2220  nitroreductase family protein  41.76 
 
 		 194 aa  150  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.605376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  43.24 
 
 		 187 aa  148  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  41.4 
 
 		 217 aa  147  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  42.51 
 
 		 169 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0450  nitroreductase  38.5 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.58966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1800  nitroreductase  38.81 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2271  nitroreductase  42.71 
 
 		 194 aa  141  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2042  nitroreductase  41.21 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.258273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  40.33 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1843  nitroreductase  41.76 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32071  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2592  nitroreductase  41.97 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2317  nitroreductase  41.97 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  0.193364 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  39.79 
 
 		 191 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7206  nitroreductase  44.32 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.347325  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  43.09 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  39.15 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1056  nitroreductase  43.96 
 
 		 195 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  40 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1069  nitroreductase family protein  38.04 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.600572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1033  nitroreductase family protein  38.04 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.680081  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  38.5 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3754  nitroreductase  40.44 
 
 		 205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.951056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  36.41 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  37.78 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  36.84 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  37.36 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  36.26 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  36.26 
 
 		 182 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  39.01 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  36.26 
 
 		 182 aa  118  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  36.52 
 
 		 182 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  36.84 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  36.84 
 
 		 182 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0371  nitroreductase  39.57 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.408673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  40.12 
 
 		 183 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2466  nitroreductase  41.85 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.294476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  34.5 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  37.43 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0809  hypothetical protein  41.3 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3161  nitroreductase  38.42 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.497099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  35.67 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  37.43 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  37.43 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  37.43 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  37.43 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  37.43 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  39.26 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  34.5 
 
 		 182 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  36.84 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  38.27 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  36.63 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2627  hypothetical protein  41.34 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.632412  normal  0.0266361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  35.29 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  38.83 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  36.2 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  37.65 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  36.2 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  33.92 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  35.12 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  36.96 
 
 		 191 aa  104  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  36.2 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1004  nitroreductase  33.33 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.97914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  35.8 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  32.74 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  32.74 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  31.58 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  32.75 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  32.74 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>