289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0056 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0056  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  223  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0233417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1358  hypothetical protein  71.17 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110789  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0797  hypothetical protein  66.67 
 
 		 111 aa  133  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.891602  normal  0.0353657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1811  hypothetical protein  56.7 
 
 		 107 aa  117  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.82325  normal  0.803316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  55.67 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  55.67 
 
 		 107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3143  hypothetical protein  54.64 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4751  hypothetical protein  54.64 
 
 		 107 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4242  hypothetical protein  51.55 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.744813  hitchhiker  0.0034155 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1122  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0046  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1360  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2205  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0750998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2372  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2243  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0461553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1737  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal  0.0464843 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1850  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00325862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1764  hypothetical protein  48.08 
 
 		 108 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0408382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1850  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183453  normal  0.129775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5127  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0017453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1447  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  95.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144293  normal  0.0886096 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6253  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127485  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1826  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0387614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1573  hypothetical protein  50.52 
 
 		 108 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0202181  hitchhiker  0.00000255943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0952  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  94  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0417166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1827  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.878322  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2360  hypothetical protein  47.12 
 
 		 108 aa  93.6  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0900418  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0275  hypothetical protein  45.36 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.08475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2220  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  93.6  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187397  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  48.08 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  48.08 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  48.08 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2111  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00197936  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2128  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144377  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1400  hypothetical protein  44.23 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.851701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1975  hypothetical protein  45.19 
 
 		 108 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119548 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2533  hypothetical protein  45.37 
 
 		 108 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180603  normal  0.572241 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  48.45 
 
 		 108 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0111  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.452353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0807  hypothetical protein  44.23 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0237853  hitchhiker  0.000000927658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2533  hypothetical protein  48.45 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.344639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1336  valyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0849671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  47.37 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  45.36 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0516  hypothetical protein  47.92 
 
 		 108 aa  88.2  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.384172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1036  hypothetical protein  47.27 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.438552  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0649  conserved hypothetical protein DUF149  47.12 
 
 		 114 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1128  hypothetical protein  47.27 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0022  hypothetical protein  46.39 
 
 		 107 aa  87.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121154  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2896  hypothetical protein  45.36 
 
 		 99 aa  87.8  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825896  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  47.42 
 
 		 114 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3433  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1020  hypothetical protein  46.39 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.186171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3038  hypothetical protein  46.39 
 
 		 109 aa  87  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0033  hypothetical protein  45.36 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0434672  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0033  hypothetical protein  45.36 
 
 		 107 aa  87  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4268  hypothetical protein  43.4 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1192  hypothetical protein  44.55 
 
 		 115 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  0.460114 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3833  hypothetical protein  43.4 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.869154  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1600  hypothetical protein  43.4 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.599296  normal  0.129358 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2646  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1857  hypothetical protein  45.36 
 
 		 108 aa  85.5  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3586  hypothetical protein  43.4 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2331  hypothetical protein  45.71 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4396  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4076  hypothetical protein  44.79 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3800  hypothetical protein  41.35 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01098  hypothetical protein  43.75 
 
 		 109 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0142015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44620  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151408  normal  0.274128 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  44.33 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03086  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1239  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3743  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1854  hypothetical protein  44.33 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.817534  normal  0.34836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19840  hypothetical protein  41.35 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002886  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2645  hypothetical protein  45.71 
 
 		 110 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439109 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4902  hypothetical protein  44.76 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0951  hypothetical protein  43.3 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0862598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0858  hypothetical protein  44.23 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2276  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  43.14 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  40.21 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  43.27 
 
 		 114 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0436  hypothetical protein  44.33 
 
 		 107 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1216  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1122  hypothetical protein  41.35 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  44.33 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1509  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000444013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1794  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000138787  hitchhiker  0.000000117364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2851  hypothetical protein  44.33 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000248364  hitchhiker  0.000000268908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  40.21 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3139  conserved hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000114318  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0590  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02442  hypothetical protein  44.33 
 
 		 98 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0536  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.529498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0403  hypothetical protein  41.24 
 
 		 109 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0388761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>