37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00080  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.852308  normal  0.387061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0008  hypothetical protein  73.91 
 
 		 288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0008  hypothetical protein  55.56 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0016  hypothetical protein  55.56 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403515  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0008  hypothetical protein  55.56 
 
 		 290 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0746422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0820  hypothetical protein  54.4 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12406  normal  0.666068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10007  hypothetical protein  52.71 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0008  hypothetical protein  50.75 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0012  hypothetical protein  58.2 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.984121  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0011  hypothetical protein  52.5 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0007  hypothetical protein  48.74 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0008  hypothetical protein  36.62 
 
 		 202 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.252458 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0008  hypothetical protein  47.62 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0009  hypothetical protein  51.61 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00080  hypothetical protein  41.78 
 
 		 275 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0010  hypothetical protein  50.81 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.455486  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0008  hypothetical protein  37.84 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.327365  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0008  hypothetical protein  39.49 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0517431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0008  hypothetical protein  44.44 
 
 		 645 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0008  hypothetical protein  47.06 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00852528 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0009  hypothetical protein  37.9 
 
 		 228 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0009  hypothetical protein  55.14 
 
 		 107 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0009  hypothetical protein  44.44 
 
 		 215 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0008  hypothetical protein  43.07 
 
 		 274 aa  95.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00070  hypothetical protein  38.22 
 
 		 166 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0007  hypothetical protein  45.16 
 
 		 152 aa  91.7  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0008  hypothetical protein  38.84 
 
 		 305 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0008  hypothetical protein  37.96 
 
 		 135 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.526139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0008  hypothetical protein  42.86 
 
 		 178 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.368186  normal  0.576466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0008  putative integral membrane protein  39.02 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000831576 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0008  hypothetical protein  48.65 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0008  hypothetical protein  41.91 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0008  hypothetical protein  39.83 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00120  hypothetical protein  36.13 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1430  hypothetical protein  34.39 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00080  hypothetical protein  33.86 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0039  hypothetical protein  35.48 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>