More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1129 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1129  superoxide dismutase  100 
 
 		 225 aa  471  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0395543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  55.68 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  52.41 
 
 		 233 aa  218  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  52.41 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  51.85 
 
 		 193 aa  217  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  54.55 
 
 		 192 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  51.58 
 
 		 198 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  51.05 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  51.05 
 
 		 198 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  51.05 
 
 		 198 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  51.05 
 
 		 198 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  51.6 
 
 		 193 aa  215  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1853  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000511005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  51.87 
 
 		 193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  53.23 
 
 		 193 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  51.06 
 
 		 192 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00002429  hitchhiker  0.00000111544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1863  superoxide dismutase  52.43 
 
 		 192 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.410173  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  51.34 
 
 		 193 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1756  superoxide dismutase  52.43 
 
 		 192 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000049091  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  51.34 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000440254  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  51.34 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  51.34 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  51.34 
 
 		 192 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4363  superoxide dismutase, Fe  51.32 
 
 		 193 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  51.87 
 
 		 192 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2571  superoxide dismutase  51.89 
 
 		 192 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.489375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 193 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  50 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  50 
 
 		 192 aa  210  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  49.73 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  51.32 
 
 		 194 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000439358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  50.27 
 
 		 192 aa  208  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  51.32 
 
 		 194 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000821956  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  51.32 
 
 		 194 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  51.32 
 
 		 194 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000289489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2428  superoxide dismutase  51.08 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.785927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4059  superoxide dismutase  49.74 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  49.2 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2196  superoxide dismutase  51.09 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.515732  hitchhiker  0.00000576689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000380978  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000641638  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  50.27 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  50.27 
 
 		 192 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  50.79 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1687  superoxide dismutase  50.79 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000404322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2881  superoxide dismutase, Fe  50.79 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  48.66 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  50.27 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  48.66 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  48.66 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  48.66 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  48.66 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  48.66 
 
 		 192 aa  205  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2526  superoxide dismutase [Fe] protein  51.34 
 
 		 192 aa  204  8e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0270769 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  49.2 
 
 		 192 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1920  superoxide dismutase  50.26 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00591973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  48.95 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000205445  hitchhiker  0.00000630572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  49.19 
 
 		 192 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  49.19 
 
 		 192 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  49.19 
 
 		 192 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0050  superoxide dismutase (Fe)  48.98 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.408378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1791  superoxide dismutase  51.85 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.027396 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  48.53 
 
 		 209 aa  198  6e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2159  superoxide dismutase  49.21 
 
 		 193 aa  198  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.18708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  48.42 
 
 		 193 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0947  Superoxide dismutase  49.2 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.367199  normal  0.0414637 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0184  superoxide dismutase, Fe  48.24 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0164  superoxide dismutase, Fe  48.24 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0205  superoxide dismutase, Fe  48.24 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.570423  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0298  superoxide dismutase  47.89 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.775999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1895  superoxide dismutase (Fe)  47.89 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0328  superoxide dismutase (Fe)  51.31 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.731602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  48.04 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  47.55 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000500167  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  47.59 
 
 		 192 aa  194  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1312  superoxide dismutase (Fe)  50.26 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000018669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  47.85 
 
 		 194 aa  194  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2463  Superoxide dismutase  47.09 
 
 		 193 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1373  Superoxide dismutase  45.41 
 
 		 192 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.509917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2445  superoxide dismutase  48.15 
 
 		 193 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.103269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1834  superoxide dismutase  49.46 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000110112  normal  0.958041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  46.07 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000440787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  46.88 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1747  superoxide dismutase  46.32 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000473936  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0032  superoxide dismutase(Fe)  49.47 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000179018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  47.28 
 
 		 194 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  46.07 
 
 		 199 aa  191  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  50.26 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  46.07 
 
 		 197 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  47.34 
 
 		 193 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  48.91 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>