58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3428 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3428  PTS system sorbose subfamily IIB component  100 
 
 		 164 aa  342  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000324846  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1316  PTS system sorbose subfamily IIB component  68.71 
 
 		 164 aa  236  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.482248  normal  0.251904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1272  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  66.46 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00454576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3254  PTS system sorbose subfamily IIB component  49.38 
 
 		 167 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4280  PTS system sorbose subfamily IIB component  39.63 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3008  PTS system sorbose subfamily IIB component  38.27 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.143042  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0348  PTS system, IIB component  25.95 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2097  PTS system sorbose subfamily IIB component  26.95 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2968  PTS system, IIB component  23.64 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.57 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  28.57 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  28.57 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1097  PTS system sorbose subfamily IIB component  28.77 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00631969  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  27.21 
 
 		 313 aa  54.3  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  26.17 
 
 		 322 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  25.97 
 
 		 323 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.17 
 
 		 322 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.85 
 
 		 318 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  26.17 
 
 		 322 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3025  PTS system sorbose subfamily IIB component  34.09 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  26.17 
 
 		 322 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  26.17 
 
 		 322 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  24.83 
 
 		 323 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0379  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB  24.1 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  24.66 
 
 		 320 aa  50.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3475  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.08 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255875  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25.85 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  26.17 
 
 		 322 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0951  PTS system sorbose subfamily IIB component  40.82 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0985047  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3699  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  25 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000890287  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1950  PTS system, IIB component  31.39 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1675  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  23.97 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0135  PTS system sorbose subfamily IIB component  35.56 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1993  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  23.21 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.396142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3847  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  24 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9499 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1066  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  23.78 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3399  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  24.31 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00196922  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3206  PTS system sorbose subfamily IIB component  23.53 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3951  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.56 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1716  PTS system, IIB component  33.87 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  51.43 
 
 		 323 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0401  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  23.08 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0397  PTS system, IIB component  23.08 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  42.11 
 
 		 322 aa  42.7  0.002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  22.38 
 
 		 329 aa  42  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0688  PTS system sorbose subfamily IIB component  24.22 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0629  PTS system sorbose-specific transporter subunit IIB  24.22 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4790  PTS system, IIB component  20.13 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.674783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4944  PTS system IIB component  20.13 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4950  PTS system transporter subunit IIB  20.13 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.315233  normal  0.320869 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4891  PTS system transporter subunit IIB  20.13 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>