13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1341 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  78.31 
 
 		 194 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  74.73 
 
 		 195 aa  293  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  75 
 
 		 195 aa  290  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  59.09 
 
 		 192 aa  210  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  54.84 
 
 		 189 aa  207  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 190 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  26.45 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  32.08 
 
 		 259 aa  49.3  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  27.04 
 
 		 259 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>