22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1340 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  607  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00430506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1235  hypothetical protein  48.38 
 
 		 299 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2406  hypothetical protein  43.39 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1988  hypothetical protein  46.15 
 
 		 297 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2196  hypothetical protein  41.18 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2273  hypothetical protein  41.18 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.308758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06646  hypothetical protein  43.96 
 
 		 278 aa  235  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1847  hypothetical protein  40.14 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00110245  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1881  hypothetical protein  40.14 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000377612  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2444  hypothetical protein  40.14 
 
 		 287 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1833  hypothetical protein  39.79 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000548981  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2199  hypothetical protein  41.34 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1585  hypothetical protein  41.26 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2000  hypothetical protein  41.87 
 
 		 286 aa  221  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000240648  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1743  hypothetical protein  39.37 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2641  hypothetical protein  40.41 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.332337  normal  0.0619929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2513  hypothetical protein  40.78 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269541  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1480  hypothetical protein  34.68 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2311  hypothetical protein  37.41 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.141718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4325  hypothetical protein  22.78 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3519  hypothetical protein  22.03 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03105  hypothetical protein  24.71 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>