22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03105 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03105  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  554  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3519  hypothetical protein  71.31 
 
 
272 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4325  hypothetical protein  26.56 
 
 
304 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1585  hypothetical protein  23.86 
 
 
299 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2641  hypothetical protein  22.22 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.332337  normal  0.0619929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1988  hypothetical protein  21.58 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1847  hypothetical protein  20.21 
 
 
287 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00110245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1833  hypothetical protein  20.21 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000548981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2444  hypothetical protein  20.21 
 
 
287 aa  52  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0235041  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1881  hypothetical protein  20.21 
 
 
287 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000377612  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1480  hypothetical protein  18.61 
 
 
303 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.805933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1235  hypothetical protein  21.4 
 
 
299 aa  49.3  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110146  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1743  hypothetical protein  19.05 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2199  hypothetical protein  20.07 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2311  hypothetical protein  20.74 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.141718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2513  hypothetical protein  19.66 
 
 
290 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.269541  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1340  hypothetical protein  24.71 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00430506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3730  hypothetical protein  25.64 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.911153  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2000  hypothetical protein  18.51 
 
 
286 aa  43.5  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000240648  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2406  hypothetical protein  18.9 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.23744  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2273  hypothetical protein  20.48 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.308758  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2196  hypothetical protein  20.48 
 
 
307 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>