54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0284 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4649  hypothetical protein  71.11 
 
 		 183 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.851642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3559  hypothetical protein  56.44 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  52.41 
 
 		 168 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  51.2 
 
 		 168 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  50.6 
 
 		 168 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  49.4 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  44.89 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4470  hypothetical protein  49.69 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3928  hypothetical protein  47.51 
 
 		 181 aa  168  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0260  hypothetical protein  48.86 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.454469  hitchhiker  0.00000127449 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3762  hypothetical protein  48.3 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0259  hypothetical protein  47.73 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  42.7 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0322  hypothetical protein  48.39 
 
 		 174 aa  151  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482084  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3456  hypothetical protein  42.41 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0467663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  35.39 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  32.98 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  31.18 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  31.18 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0399  hypothetical protein  32.35 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  27.37 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5857  hypothetical protein  27.74 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3486  hypothetical protein  30.95 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160248 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0341  hypothetical protein  28.81 
 
 		 207 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0342  hypothetical protein  34.69 
 
 		 169 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67650  hypothetical protein  27.45 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45880  hypothetical protein  26.14 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4142  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2650  hypothetical protein  28.66 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1026  hypothetical protein  30.36 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01590  hypothetical protein  34.69 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4141  hypothetical protein  30.32 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0355  hypothetical protein  29.05 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4819  hypothetical protein  34.25 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0356  hypothetical protein  32 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0244  hypothetical protein  26.01 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0014  hypothetical protein  27.63 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.997944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0768  hypothetical protein  27.61 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3260  hypothetical protein  29.1 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4820  hypothetical protein  27.16 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5856  hypothetical protein  28.48 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.480656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67640  hypothetical protein  27.4 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  21.88 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  39.06 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  34.38 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  48.48 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  37.21 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0501  hypothetical protein  22.81 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  37.21 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  34.78 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  52.94 
 
 		 151 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  48.57 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>