49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0979 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0979  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  828    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  39.01 
 
 		 381 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  28 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  27.73 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  27.73 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  27.73 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  27.73 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  27.73 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  27.73 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  28 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  27.47 
 
 		 353 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  26.98 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  26.98 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  26.98 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  26.98 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  27.81 
 
 		 353 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  26.98 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  27.68 
 
 		 352 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  27.97 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1057  putative periplasmic protein  26.53 
 
 		 361 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00889034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  23.6 
 
 		 356 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.88 
 
 		 752 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.35 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.99 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  26.15 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  21.94 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1667 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.84 
 
 		 819 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  22.76 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2907  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 		 601 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  21.27 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.97 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.43 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  22.03 
 
 		 810 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.5 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  23.99 
 
 		 451 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.74 
 
 		 192 aa  47.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.77 
 
 		 327 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  19.19 
 
 		 479 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.39 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0114  hypothetical protein  19.64 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.715385  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5321  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.56 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5410  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.186249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.3 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5700  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.25 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.851059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0196  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.89 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.367878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1880  hypothetical protein  24.53 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  22.92 
 
 		 1094 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>