More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1344 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  100 
 
 
213 aa  425  1e-118  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3974  adenylate kinase  61.72 
 
 
210 aa  245  3e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  49.3 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  46.98 
 
 
217 aa  218  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  47.66 
 
 
215 aa  211  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  48.83 
 
 
213 aa  209  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.58 
 
 
220 aa  209  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  50 
 
 
218 aa  207  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  46.98 
 
 
216 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  46.98 
 
 
216 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1416  adenylate kinase  48.65 
 
 
219 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  47.42 
 
 
216 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  50.76 
 
 
214 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  49.54 
 
 
214 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  46.73 
 
 
215 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  50.25 
 
 
214 aa  206  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  46.73 
 
 
215 aa  206  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  48.8 
 
 
214 aa  205  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  47.64 
 
 
214 aa  204  8e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  47.73 
 
 
216 aa  204  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1168  adenylate kinase  50.46 
 
 
218 aa  202  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.949155  normal  0.355887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  49.75 
 
 
214 aa  202  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  49.3 
 
 
215 aa  202  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  46.23 
 
 
213 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1366  adenylate kinase  47.3 
 
 
218 aa  201  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1362  adenylate kinase  47.3 
 
 
218 aa  201  6e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  47 
 
 
214 aa  201  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0949  adenylate kinase  53.44 
 
 
220 aa  201  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.675303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  50.26 
 
 
214 aa  201  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  49.49 
 
 
217 aa  201  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  48.83 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  44.65 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  45.58 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  48.51 
 
 
222 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  46.79 
 
 
214 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  47.32 
 
 
221 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  198  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  48.6 
 
 
214 aa  198  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  47.25 
 
 
227 aa  197  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0079  adenylate kinase  48.31 
 
 
212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000187867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  49.75 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  49.75 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  49.75 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  47.95 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  46.76 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1541  adenylate kinase  46.43 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0259287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  45.33 
 
 
217 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  43.93 
 
 
222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  46.33 
 
 
214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  44.39 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  45.62 
 
 
214 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.78 
 
 
217 aa  194  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  45.33 
 
 
224 aa  194  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  43.46 
 
 
217 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  49.47 
 
 
219 aa  194  7e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  45 
 
 
219 aa  194  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  50.79 
 
 
221 aa  193  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  52.94 
 
 
215 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  47.96 
 
 
216 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37399  predicted protein  48.47 
 
 
239 aa  193  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.889133  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  45.33 
 
 
218 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  45.21 
 
 
215 aa  192  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12732  predicted protein  42.34 
 
 
228 aa  192  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  45.28 
 
 
216 aa  192  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  46.36 
 
 
215 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  46.82 
 
 
216 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  44.86 
 
 
217 aa  192  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  46.82 
 
 
216 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  51.08 
 
 
222 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  49.47 
 
 
217 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  51.08 
 
 
222 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  44.6 
 
 
217 aa  192  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.98 
 
 
213 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  50.54 
 
 
218 aa  191  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  51.32 
 
 
218 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  43.46 
 
 
217 aa  191  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  49.74 
 
 
222 aa  191  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  44.98 
 
 
213 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  47.17 
 
 
215 aa  190  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  44.75 
 
 
215 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  46.57 
 
 
209 aa  189  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  49.49 
 
 
214 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  48.21 
 
 
218 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  48.77 
 
 
214 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  43.87 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  43.87 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  46.36 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  46.36 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  46.23 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  43.87 
 
 
216 aa  188  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  45.41 
 
 
214 aa  188  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  44.34 
 
 
216 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  43.87 
 
 
216 aa  188  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  43.26 
 
 
229 aa  188  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>