20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0124 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0124  Heparinase II/III family protein  100 
 
 
594 aa  1201    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0406  heparinase II/III-like protein  32.24 
 
 
672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0402  hypothetical protein  31.89 
 
 
672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.813066  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  26.74 
 
 
657 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1897  hypothetical protein  27.12 
 
 
634 aa  150  4e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0598703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4954  hypothetical protein  24.31 
 
 
651 aa  64.3  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5558  hypothetical protein  24.07 
 
 
651 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.030932  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  22.92 
 
 
896 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  23.82 
 
 
906 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  22.71 
 
 
908 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  22.71 
 
 
896 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2527  Heparinase II/III family protein  22.17 
 
 
675 aa  58.5  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000557992 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0433  heparinase II/III family protein  19.57 
 
 
668 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0485794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  19.58 
 
 
561 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  18.25 
 
 
528 aa  51.2  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  21.64 
 
 
545 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0471  heparinase II/III-like protein  23.24 
 
 
630 aa  48.5  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000500761  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  22.33 
 
 
541 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0460  heparinase II/III-like protein  22.27 
 
 
627 aa  45.8  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00058619  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08631  hypothetical protein  25.31 
 
 
600 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.143582  hitchhiker  0.00000750178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>