165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3826 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 		 212 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  63.03 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  59.9 
 
 		 215 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  57.35 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  46.63 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  48.94 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  40.19 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.59 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.32 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  35.41 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  39.51 
 
 		 216 aa  136  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  34.62 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.71 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40 
 
 		 214 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.29 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.1 
 
 		 212 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.35 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  37.04 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.06 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.05 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.56 
 
 		 221 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.83 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.56 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  45.9 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.21 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  35.61 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.19 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.31 
 
 		 206 aa  124  7e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.03 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  39 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.78 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.78 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.1 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  36.56 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  38.58 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.39 
 
 		 216 aa  121  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  50.27 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.63 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  40.1 
 
 		 598 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  37.1 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.1 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  37.1 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.36 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.1 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  37.1 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.71 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.86 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.79 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  38.34 
 
 		 589 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.04 
 
 		 201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.19 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.33 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.82 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  37.91 
 
 		 612 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.65 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  35.86 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.89 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.07 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.57 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.83 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  33.83 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.83 
 
 		 224 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  33.82 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  35.15 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  35.15 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.63 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  41.4 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  39.11 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.65 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  43.37 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.91 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.91 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 191 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  39.15 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  39.15 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  39.15 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.15 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  39.15 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  41.36 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  39.06 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  44.39 
 
 		 210 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.9 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  40 
 
 		 554 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  35.75 
 
 		 588 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.51 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  45.16 
 
 		 209 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  37 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.36 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.9 
 
 		 252 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  33.5 
 
 		 212 aa  95.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.38 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.16 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  33.49 
 
 		 567 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4367  Dak phosphatase  33.65 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.78 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  28.44 
 
 		 582 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.56 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  40.33 
 
 		 616 aa  85.1  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  28.24 
 
 		 583 aa  84.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>