173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1263 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 
215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.8 
 
 
215 aa  134  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.86 
 
 
212 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.11 
 
 
209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.43 
 
 
214 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  32.21 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  34.16 
 
 
212 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.01 
 
 
210 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.2 
 
 
220 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.66 
 
 
215 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  31.73 
 
 
210 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.06 
 
 
210 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.71 
 
 
221 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.66 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  31.82 
 
 
216 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.62 
 
 
210 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  32.21 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.21 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  32.21 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  32.21 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  32.21 
 
 
210 aa  118  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  32.52 
 
 
212 aa  118  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  31.73 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.61 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  30.88 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.02 
 
 
204 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30 
 
 
210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  32.62 
 
 
211 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  32.62 
 
 
211 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  31.94 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.02 
 
 
212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4661  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.23 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.439901 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.29 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.8 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.83 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  32.16 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1569  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.18 
 
 
215 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.460675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  32.47 
 
 
216 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4752  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.48 
 
 
214 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0429021  normal  0.328024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  30.64 
 
 
210 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  34.03 
 
 
207 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.16 
 
 
207 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.09 
 
 
204 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1404  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35 
 
 
221 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172962  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.51 
 
 
204 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.84 
 
 
213 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  30.39 
 
 
217 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.45 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.3 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4072  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.9 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  29.7 
 
 
192 aa  98.6  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.89 
 
 
194 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.89 
 
 
194 aa  98.2  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.76 
 
 
211 aa  98.2  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.02 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  32.83 
 
 
271 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  31.43 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30 
 
 
205 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.3 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 
612 aa  96.7  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.28 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.02 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.95 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  33.33 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.27 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.63 
 
 
211 aa  92.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.81 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.88 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.56 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  33.93 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.49 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.52 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.84 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.63 
 
 
211 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.66 
 
 
201 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  32.31 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  29.08 
 
 
598 aa  85.5  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.72 
 
 
214 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  34.44 
 
 
583 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  30.69 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0806  dihydroxyacetone kinase family protein  30.69 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1097  dihydroxyacetone kinase family protein  30.69 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0461  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.69 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0366  dihydroxyacetone kinase, subunit II  30.69 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  33.89 
 
 
583 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  32.42 
 
 
616 aa  83.2  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  34.44 
 
 
583 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.02 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  34.44 
 
 
583 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  30.43 
 
 
583 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3916  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.46 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1360  Dak phosphatase  30.65 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  31.09 
 
 
554 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.56 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  33.89 
 
 
583 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  33.89 
 
 
583 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  33.89 
 
 
583 aa  82  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  33.89 
 
 
583 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>