18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0628 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0628  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00633801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0225  hypothetical protein  48.18 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0136  hypothetical protein  48.6 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195984  normal  0.314432 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0193  hypothetical protein  45.79 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4338  hypothetical protein  41.12 
 
 		 113 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0504151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4027  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.998765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1645  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0652941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2827  hypothetical protein  37.62 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8293  hypothetical protein  36 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3510  hypothetical protein  33.66 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0485  hypothetical protein  38.78 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4127  hypothetical protein  32.14 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1571  hypothetical protein  28 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1077  protein of unknown function DUF419  35.92 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.177675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5156  hypothetical protein  30.48 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.320276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3874  hypothetical protein  28.04 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0480065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3092  protein of unknown function DUF661  27.78 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2021  hypothetical protein  31.73 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>