35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  55.8 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  51.82 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  59.42 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  53.38 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  52.99 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  53.33 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  50.42 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  60.87 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  50.39 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  48.44 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  48.74 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  46.96 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  45 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  43.57 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  44 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  46.85 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  44.17 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  45.95 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  41.6 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  44.85 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 168 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  30.12 
 
 		 232 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 242 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  28.38 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  33.71 
 
 		 267 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 246 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>