20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00270  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  366  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3725  regulatory protein ArsR  46.77 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33760  MarR family regulator  35.2 
 
 		 217 aa  91.3  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  30.38 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1731  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2343  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  32 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1516  nucleotidyltransferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.387412  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1617  hypothetical protein  26.51 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0701  hypothetical protein  22.02 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000726563  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  30.13 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  27.16 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  27.16 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  27.16 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  28.66 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0533  hypothetical protein  24.71 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0302  regulatory protein ArsR  46.55 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264205 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  33.04 
 
 		 254 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>