More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2057 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
136 aa  279  7e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  8.66783e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
136 aa  279  7e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
136 aa  279  7e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  97.79 
 
 
165 aa  277  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2269  lactoylglutathione lyase  99.26 
 
 
136 aa  276  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151296  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4555  hypothetical protein  99.26 
 
 
136 aa  276  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  95.59 
 
 
136 aa  271  2e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  94.85 
 
 
136 aa  270  4e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  94.12 
 
 
136 aa  269  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  94.12 
 
 
136 aa  269  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  86.03 
 
 
136 aa  248  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  84.56 
 
 
136 aa  246  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  84.56 
 
 
136 aa  244  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  83.09 
 
 
136 aa  239  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  82.35 
 
 
136 aa  234  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  77.94 
 
 
136 aa  231  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  78.68 
 
 
136 aa  229  7e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  73.88 
 
 
135 aa  203  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  4.14723e-06 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  73.13 
 
 
135 aa  200  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  71.64 
 
 
135 aa  199  1e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.24118e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  71.64 
 
 
135 aa  199  1e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  67.91 
 
 
136 aa  196  7e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  70.9 
 
 
146 aa  196  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  70.9 
 
 
135 aa  196  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.6884e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  70.15 
 
 
135 aa  195  1e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  68.42 
 
 
138 aa  193  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  69.4 
 
 
135 aa  190  5e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  69.4 
 
 
135 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  69.4 
 
 
135 aa  190  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  69.4 
 
 
135 aa  190  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  69.4 
 
 
135 aa  190  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  6.56309e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  69.4 
 
 
135 aa  190  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  69.4 
 
 
135 aa  190  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  67.16 
 
 
135 aa  189  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  68.66 
 
 
135 aa  189  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  68.66 
 
 
135 aa  189  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  69.53 
 
 
129 aa  188  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  68.75 
 
 
138 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  66.42 
 
 
135 aa  188  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  69.53 
 
 
129 aa  187  3e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  67.16 
 
 
135 aa  187  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  67.91 
 
 
135 aa  187  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  72.8 
 
 
136 aa  187  6e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  67.16 
 
 
135 aa  187  6e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  67.16 
 
 
135 aa  187  6e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  67.16 
 
 
135 aa  187  6e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  67.16 
 
 
135 aa  187  6e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  67.16 
 
 
136 aa  186  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  68.75 
 
 
138 aa  186  8e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  68.75 
 
 
138 aa  186  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  66.17 
 
 
138 aa  185  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.01735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  67.19 
 
 
158 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  68.18 
 
 
135 aa  183  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  66.42 
 
 
136 aa  182  2e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  65.91 
 
 
135 aa  181  4e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  66.67 
 
 
135 aa  181  4e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  62.69 
 
 
137 aa  178  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  68.75 
 
 
129 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  67.97 
 
 
135 aa  178  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  67.97 
 
 
129 aa  177  5e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  67.97 
 
 
129 aa  176  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  66.41 
 
 
129 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  65.62 
 
 
129 aa  175  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  60.15 
 
 
142 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  62.12 
 
 
135 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  60.31 
 
 
145 aa  174  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  67.19 
 
 
135 aa  173  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
129 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
129 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
129 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
129 aa  172  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
129 aa  172  1e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
129 aa  172  1e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  64.84 
 
 
238 aa  172  1e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  66.41 
 
 
128 aa  171  4e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  61.9 
 
 
128 aa  170  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  62.7 
 
 
144 aa  170  6e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  65.6 
 
 
128 aa  170  7e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  64.84 
 
 
128 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  4.51487e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  61.6 
 
 
127 aa  169  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  62.4 
 
 
137 aa  169  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  60.16 
 
 
143 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  60.16 
 
 
143 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  58.78 
 
 
132 aa  168  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  62.5 
 
 
128 aa  168  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  60.16 
 
 
133 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  62.31 
 
 
132 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2706  lactoylglutathione lyase  68.5 
 
 
127 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  60.47 
 
 
130 aa  167  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2733  lactoylglutathione lyase  68.5 
 
 
127 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2094  glyoxalase I  68.5 
 
 
127 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  60.16 
 
 
128 aa  166  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  5.58126e-06  hitchhiker  4.9378e-08 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  61.24 
 
 
129 aa  166  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  64.06 
 
 
128 aa  166  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  59.06 
 
 
130 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  63.28 
 
 
128 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  63.71 
 
 
127 aa  165  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  62.79 
 
 
131 aa  164  3e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  59.84 
 
 
127 aa  164  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  60.94 
 
 
128 aa  164  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>