More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0090 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0091  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  98.68 
 
 
607 aa  1211  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0095  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  98.85 
 
 
607 aa  1213  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0090  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
607 aa  1224  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0071  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  85.5 
 
 
607 aa  1078  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  98.68 
 
 
607 aa  1209  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2061  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.13 
 
 
604 aa  213  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.36158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0505  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.14 
 
 
623 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.3 
 
 
632 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.39686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0648  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.08 
 
 
623 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00338315 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4209  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.93 
 
 
616 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0504  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  27.14 
 
 
623 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0502  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  27.14 
 
 
623 aa  176  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0718  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.14 
 
 
623 aa  176  1e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3339  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.49 
 
 
600 aa  176  1e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000608256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0591  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.14 
 
 
611 aa  176  1e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  27.14 
 
 
623 aa  176  1e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0507  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.93 
 
 
616 aa  175  2e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.949943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0658  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  26.49 
 
 
611 aa  173  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0629  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  26.81 
 
 
623 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.544167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4708  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  26.64 
 
 
623 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.831779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2677  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.83 
 
 
594 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.867713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.97 
 
 
293 aa  133  7e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.91 
 
 
247 aa  122  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13160  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28 
 
 
249 aa  121  4e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2954  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.77 
 
 
631 aa  120  5e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.35594  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.91 
 
 
245 aa  119  1e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5208  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.5 
 
 
249 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1117  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.6 
 
 
231 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.14837  normal  0.407637 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0606  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.31 
 
 
239 aa  117  8e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2740  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.61 
 
 
243 aa  116  9e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5552  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  31.49 
 
 
241 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.14 
 
 
250 aa  114  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3887  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.64 
 
 
241 aa  113  8e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.477333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2333  glycerophosphodiester phosphodiesterase, cytosolic  30.96 
 
 
241 aa  113  1e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.11179e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1581  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.47 
 
 
236 aa  113  1e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.565806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1216  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.64 
 
 
237 aa  112  2e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1604  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.51 
 
 
239 aa  112  2e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5503  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.64 
 
 
241 aa  112  2e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2092  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.78 
 
 
250 aa  111  4e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275875  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.13 
 
 
243 aa  111  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.95679e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.05 
 
 
259 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1652  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.05 
 
 
247 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5054  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  31.06 
 
 
241 aa  110  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5469  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.61 
 
 
254 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.95 
 
 
271 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.49147e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14680  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.51 
 
 
240 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0053  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.57 
 
 
284 aa  109  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2245  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.74 
 
 
280 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5466  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.64 
 
 
241 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5222  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.64 
 
 
241 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.54 
 
 
247 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000170657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1811  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.54 
 
 
247 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00873752  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2792  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.45 
 
 
299 aa  107  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.714431 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.64 
 
 
241 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5454  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  30.21 
 
 
241 aa  107  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0258  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.92 
 
 
242 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5496  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  29.36 
 
 
241 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0218  hypothetical protein  22.14 
 
 
587 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.381171  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0212  hypothetical protein  22.14 
 
 
587 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18890  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.69 
 
 
266 aa  106  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.231649  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0937  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.07 
 
 
257 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5070  glycerophosphodiester phosphodiesterase (glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)  29.79 
 
 
241 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.422276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5167  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.79 
 
 
241 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1669  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.82 
 
 
238 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1285  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  27.43 
 
 
248 aa  104  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000464019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4126  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.22 
 
 
238 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0608  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.5 
 
 
257 aa  104  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46198e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1693  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.39 
 
 
238 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2689  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.23 
 
 
292 aa  104  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.693483  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3590  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.44 
 
 
238 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30357 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2152  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.44 
 
 
238 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00746695 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0998  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.07 
 
 
257 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2107  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  29 
 
 
240 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.909521  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2131  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  28.14 
 
 
238 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0074  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.03 
 
 
257 aa  103  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1636  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.08 
 
 
627 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.41391 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.77 
 
 
242 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1922  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.09 
 
 
257 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3861  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.14 
 
 
240 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2703  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  25.27 
 
 
287 aa  101  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  5.18352e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2312  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.96 
 
 
244 aa  101  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000853  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.47 
 
 
239 aa  100  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0995  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.65 
 
 
257 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0576  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.48 
 
 
320 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06395  lycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.03 
 
 
250 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2446  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.82 
 
 
287 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2465e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2472  glycerophosphodiester phosphodiesterase  26.23 
 
 
291 aa  99.4  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054422  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3926  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.26 
 
 
247 aa  99  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25400  putative phosphodiesterase  30.17 
 
 
240 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0262  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.74 
 
 
224 aa  98.2  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.479263  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.23 
 
 
291 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  7.47655e-07 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1902  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.57 
 
 
240 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128239 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03251  hypothetical protein  30.26 
 
 
247 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.957517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2655  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.76 
 
 
237 aa  98.2  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.24371e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0267  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.26 
 
 
247 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0866161  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2051  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.19 
 
 
245 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3727  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.13 
 
 
247 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03298  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.26 
 
 
247 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.96147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3875  cytoplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.26 
 
 
247 aa  98.2  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1875  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.44 
 
 
254 aa  97.8  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>