56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_18850 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_18850  DNA-binding protein, excisionase family  100 
 
 		 109 aa  223  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0755115 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  38.6 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  44.07 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  36.67 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  40 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  32.43 
 
 		 90 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  35.38 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  35 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  39.68 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  44 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  44 
 
 		 67 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  32.79 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  40.82 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  33.87 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  42 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  42.31 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  42.86 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  46.51 
 
 		 315 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  37.5 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  46.51 
 
 		 315 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  46.51 
 
 		 306 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  44.19 
 
 		 315 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  44.44 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  38.78 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  44.19 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  44.19 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  40.38 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  44.19 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  35.19 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1224  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  41.86 
 
 		 306 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 305 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  44.68 
 
 		 315 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  41.86 
 
 		 306 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  38.46 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  41.86 
 
 		 306 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2463  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000388448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02150  DNA-binding protein, excisionase family  41.86 
 
 		 248 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  34.04 
 
 		 317 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0025  DNA binding domain protein, excisionase family  41.3 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.917253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>