27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0395 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  326  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50.31 
 
 
177 aa  156  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  34 
 
 
177 aa  84.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.94 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.93 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.08 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  34.34 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.24 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.55 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  28.68 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.1 
 
 
182 aa  53.9  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  30.56 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.55 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.52 
 
 
182 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  29.17 
 
 
183 aa  52  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  34.65 
 
 
188 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.74 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 
185 aa  48.1  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.01 
 
 
202 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  23.78 
 
 
437 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.58 
 
 
187 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.08 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.77 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  27.97 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.68 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>